Юго-восточные динго отличились от северо-западных родством с новогвинейскими поющими собаками

Ученые реконструировали популяционную историю динго. Анализ геномов древних представителей этих псовых, которые жили от 400 до 2746 лет назад, показал, что их предки попали в Австралию от 3000 до 8000 лет назад. При этом уже 2000 лет назад древние динго разделились на северо-западную и юго-восточную ветви, граница между которыми проходит по Большому Водораздельному хребту. Эта популяционная структура существует и по сей день. Кроме того, исследователи выявили у восточных динго свидетельства обмена генами с новогвинейскими поющими собаками — и пришли к выводу, что у большинства современных динго примесь генов от европейских пород собак незначительна. Результаты исследования опубликованы в статье для журнала Proceedings of the National Academy of Sciences.

Динго (Canis lupus dingo) проникли в Австралию вместе с людьми от пяти до восьми с половиной тысяч лет назад. Здесь они быстро освоились и заняли нишу верховных хищников континента, возможно, попутно вытеснив сумчатых волков (Thylacinus cynocephalus) отовсюду, кроме Тасмании. Предполагается, что большую часть своей истории динго развивались в полной изоляции от других псовых и даже после начала активной колонизации Австралии европейцами в XVIII веке редко скрещивались с представителями завезенных пород.

Команда зоологов под руководством Яссина Соулми (Yassine Souilmi) из Аделаидского университета решила больше узнать о ранних этапах эволюции динго. Для этого исследователи проанализировали митохондриальные и ядерные геномы динго, останки которых возрастом от 400 до 2746 лет были обнаружены в пещерах и местах археологических раскопок в Западной, Южной и Восточной Австралии. Кроме того, в выборку включили геномы современных динго (включая особей с острова Фрейзер у побережья Восточной Австралии, которые, как считается, несут меньше всего примесей от европейских пород), новогвинейских поющих собак (родственников динго, которые обитают на острове Новая Гвинея) и домашних собак из Юго-Восточной Азии и со всего мира.

Анализ митохондриальной ДНК 16 древних динго позволил разделить этих псовых на две клады. К первой относятся древние особи из Южной Австралии и современные из северо-западной части континента. Во вторую входят древние и современные особи из Юго-Восточной Австралии и два представителя новогвинейских поющих собак. По оценкам исследователей, последний общий предок первой группы жил от 3424 до 8244 лет назад, а второй — от 2856 до 7944 лет назад. Таким образом, динго были завезены в Австралию в течение этого временного промежутка.

С точки зрения ядерного генома (он был проанализирован у девяти древних экземпляров) древние динго оказались похожими на современных динго и новогвинейских поющих собак. Ныне живущие представители этих псовых с острова Фрейзер и из Северного Квинсленда имеют больше общего с древними особями из прибрежного Нового Южного Уэльса. Современные динго из региона Кимберли и пустыни Гибсон в Западной Австралии генетически связаны с древними из Южной Австралии. А особи, обитающие в пустыне Симпсон и на Северной территории, примерно одинаково похожи на древних сородичей из Южной и Восточной Австралии, хотя остается неясным, происходят ли они от смешения двух этих популяций. Таким образом, анализ ядерного генома подтвердил разделение динго на две клады, выявленное в ходе анализа митохондриального генома.

По словам Соулми и его коллег, морфологические и генетические различия между северо-западными и юго-восточными динго были обнаружены уже довольно давно и считались результатом изоляции из-за пересекающего всю Австралию забора для защиты скота, который был возведен в конце XIX века. Однако результаты исследования демонстрируют, что современная популяционная структура этих псовых, с проходящей по Большому Водораздельному хребту границей между двумя группами, возникла не менее 2000 лет назад.

Авторы также обнаружили, что динго из разных регионов Австралии отличаются друг от друга степенью родства с новогвинейскими поющими собаками. У древних особей из Нового Южного Уэльса больше общих генов с этими псовыми, чем у их древних и современных сородичей из Западной и Южной Австралии. При этом сильнее всего на поющих собак похожи некоторые древние особи из Нового Южного Уэльса (одна из них напоминала этих псовых не только геномом, но и мелкими размерами и строением зубов) и современные динго альпийского экотипа из Виктории и с юга Нового Южного Уэльса. Исследователи не смогли установить, в каком именно направлении шел поток генов. Возможно, поющие собаки унаследовали часть генов от древних динго или предками некоторых динго были поющие собаки. Как бы то ни было, две эти группы разошлись в отдаленном прошлом, после чего, около 2456 лет назад, произошло скрещивание новогвинейских поющих собак и предков динго из Юго-Восточной Австралии.

На основе полученных результатов Соулми и его коллеги представили два возможных сценария того, как динго заселили Австралию. Согласно одному из них, на континент вместе с людьми независимо друг от друга попали две эволюционные линии этих псовых. От первой из них ведут род все северо-западные динго, а от родственной ей второй, которая еще на Новой Гвинее обменялась генами с поющими собаками, произошли юго-восточные динго. Возможно, вторая линия прибыла в Австралию позже первой. Альтернативная версия предполагает, что все австралийские динго произошли от одной предковой популяции, которая позднее разделилась на две группы, северо-западную и юго-восточную. Позднее особи с юго-востока передали часть аллелей предкам новогвинейских поющих собак в результате эпизодической торговли или других редких контактов между аборигенами Австралии и Новой Гвинеи. По словам авторов, эти гипотезы не исключают друг друга: например, существует вероятность, что поток генов между поющими собаками и юго-восточными динго был двунаправленным.

На финальном этапе исследования Соулми и его соавторы провели полногеномный анализ однонуклеотидных полиморфизмов у 14 современных динго. Из них 13 ранее были признаны чистокровными на основе изучения микросателлитной ДНК. Сравнив полученные данные с информацией о геномах древних динго, авторы пришли к выводу, что у большинства особей из выборки отсутствуют примеси от европейских пород собак. Однако у двух животных, которые считались чистокровными, такие примеси все же были обнаружены, хотя и минимальные. Таким образом, анализ происхождения динго, который не опирается на данные о древних представителях этих псовых, может привести к ошибочным результатам. Впрочем, исследователи все же склонны считать, что большинство современных динго либо чистокровные, либо несут минимальную примесь от европейских пород. К похожим выводам привел анализ, проведенный несколько лет назад.

Ранее мы рассказывали о том, как ученые исследовали захоронения динго, сделанные австралийскими аборигенами. В частности, они проанализировали останки животных, найденные на стоянке под скальным навесом, которую раскопали недалеко от Сиднея. Здесь они нашли свидетельства того, что аборигены хоронили пожилых динго и их щенков больше двух тысяч лет назад, причем на этом же памятнике присутствуют и человеческие захоронения.