Генетики выделили ДНК из кости неандертальца из пещеры со следами каннибализма

Палеогенетики прочитали ДНК из фрагмента неандертальской челюсти, который археологи нашли в испанской пещере Кова-де-лес-Тейксонерес. Митохондриальный геном этого архаичного человека попал в одну кладу с геномом неандертальца из пещеры Холенштайн-Штадель, а последовательность Y-хромосомы испанского индивида, по данным исследователей, была базальной по отношению ко всем известным неандертальским отцовским линиям. Об этом недавно ученые рассказали в Загребе на ежегодном собрании Европейского общества по изучению эволюции человека.

В испанской провинции Барселона находится пещера Кова-де-лес-Тейксонерес, которую в качестве археологического объекта еще в 1950-х годах открыли местные спелеологи. В первую очередь этот памятник известен благодаря тому, что периодически в эпоху среднего палеолита его неоднократно посещали неандертальцы, которые, возможно, использовали пещеру в качестве кратковременного лагеря, однако, по-видимому, чаще в ней можно было встретить диких зверей, которые устраивали там логова.

Помимо каменных артефактов и остатков животных, в 2016 году археологи обнаружили в этой пещере останки как минимум трех неандертальцев: ребенка примерно шести—семи лет, подростка старше 11 лет и взрослого индивида. В 2023 году к ним добавились два фрагмента черепа неандертальского юноши. Причем контекст находок и следы от орудий на одной из раскопанных ключиц говорили о том, что как минимум часть из этих архаичных людей могла быть жертвами каннибалов.

На ежегодном собрании Европейского общества по изучению эволюции человека, которое на прошлой неделе проходило в хорватском Загребе, группа ученых из Германии, Испании, Италии, Португалии и Франции, возглавляемая Маттиасом Мейером (Matthias Meyer) из Института эволюционной антропологии Общества Макса Планка, сообщила о результатах генетических исследований материалов из пещеры Кова-де-лес-Тейксонерес. Для анализа палеобиологи отобрали образцы пещерного грунта и два фрагмента костей, которые нашли в слое возрастом не меньше 60 тысяч лет.

По словам ученых, первая кость представляла собой фрагмент нижней челюсти, который удалось выявить среди фаунистических остатков лишь благодаря масс-спектрометрической пептидной дактилоскопии (ZooMS). Второй образец останков представлял собой обломок ключицы, который в качестве неандертальского определили по морфологии. Попытка выделить ДНК увенчалась успехом лишь в случае фрагмента нижней челюсти, в то время как извлечь ее из ключицы не получилось.

Палеогенетики проанализировали митохондриальный геном архаичного человека, который удалось прочесть со средней глубиной покрытия 41 раз. По их данным, он относится к той же кладе, что и митохондриальный геном немецкого неандертальца из пещеры Холенштайн-Штадель. В эту же кладу также попадают еще всего лишь несколько последовательностей древнее 100 тысяч лет назад. Дальнейшие исследования показали, что индивид из Испании был мужчиной, последовательность Y-хромосомы которого ученые прочитали со средней глубиной покрытия 0,27 раза. Несмотря на невысокое качество этой последовательности, палеогенетики определили, что отцовская линия испанского неандертальца была базальной по отношению ко всем остальным опубликованным линиям у этих архаичных людей.

Исследователи также частично прочитали и последовательность остального ядерного генома испанского индивида и сравнили ее с тремя опубликованными высококачественными неандертальскими геномами: 50-тысячелетним Vindija-33.19 из хорватской пещеры Виндия, 55-тысячелетним Chagyrskaya-B из алтайской пещеры Чагырская и 120-тысячелетним Denisova-5 из алтайской пещеры Денисова (еще два высококачественных неандертальских генома из Денисовой пещеры и бельгийского памятника Гойе пока не опубликованы). Ближе всего геном индивида из пещеры Кова-де-лес-Тейксонерес оказался к неандерталке из пещеры Виндия. Однако и их популяции разошлись очень давно — около 128 тысяч лет назад.

Кроме того, ученые проанализировали ДНК в образцах грунта из пещеры Кова-де-лес-Тейксонерес. По их словам, они не сумели найти человеческого генетического материала в культурном слое, в котором обнаружили фрагмент исследованной нижней челюсти. Тем не менее палеогенетики выделили митохондриальную ДНК, близкую к образцу из пещеры Холенштайн-Штадель, в более древнем слое, а также из шести образцов из более молодых слоев. Митохондриальная ДНК из последних, по данным исследователей, оказалась близка к кавказскому неандертальцу из Мезмайской пещеры (Mezmayskaya-1) и алтайскому неандертальцу из пещеры Окладникова (Okladnikov-14).

Недавно исследователи рассказали, что они сумели прочитать древнейший высококачественный геном человека. ДНК отличной сохранности они сумели выделить из зуба денисовца, жившего на Алтае около 200 тысяч лет назад.