Генетики впервые прочитали митохондриальную ДНК синомегацеросов

Палеогенетики впервые секвенировали шесть митохондриальных геномов большерогих оленей из рода Sinomegaceros. При филогенетическом анализе две из трех выявленных клад попали в пределы генетического разнообразия большерогих оленей из рода Megaloceros, несмотря на то, что, судя по морфологии, эти таксоны разделились больше одного миллиона лет назад. Еще одна клада, обнаруженная у синамегацеросов, на филогенетическом дереве отделилась от всех других известных митохондриальных линий мегацеринов раньше всех — около 599 тысяч лет назад. Об этом сообщается в статье, опубликованной в журнале iScience.

Мегацерины (большерогие олени) были яркими представителями евразийской плейстоценовой мегафауны. Их останки найдены от Ирландии на западе до Японии на востоке. Об этой трибе копытных хорошо известно благодаря гигантскому оленю (Megaloceros giganteus), появившемуся около 400 тысяч лет назад и вымершему уже в эпоху голоцена — примерно 8–6 тысяч лет назад. Ареал этого вида охватывал обширные пространства от Атлантики на западе до Восточной Сибири на востоке, где они соседствовали с другими мегацеринами из рода синомегацерос (Sinomegaceros). Последние в палеонтологической летописи представлены несколькими видами, обитавшими на территориях Центральной Азии, Китая и Японии.

Сравнение морфологии останков синомегацеросов и мегалоцеросов позволило палеонтологам прийти к выводу, что линии этих животных разошлись больше одного миллиона лет назад. Более точную оценку может дать палеогенетический анализ, однако до сих пор проводились лишь ограниченные исследования геномов мегалоцеросов.

Восполнить этот пробел решила группа ученых из Бельгии, Великобритании, Дании, Китая и России во главе с Шэн Гуйлянь (Guilian Sheng) из Китайского университета наук о земле. Исследователи отобрали для генетического анализа останки 16 синомегацеросов, самый молодой из которых, судя по радиоуглеродному анализу, жил около 20 тысяч лет назад. Возраст самых древних особей превышал разрешающую способность радиоуглеродного метода, поэтому в двух случаях ученые определили его по молекулярным часам. Так, один синомегацерос жил около 102 тысяч лет назад (134–79 тысяч лет назад при доверительном интервале (ДИ) 95 процентов), а другой — примерно 58 тысяч лет назад (75–43 тысячи лет назад при ДИ 95 процентов).

Митохондриальную ДНК большерогих оленей удалось выделить из шести образцов. Для филогенетического анализа ученые также привлекли ранее опубликованные митохондриальные геномы M. giganteus. Линии синомегацеросов сгруппировались в три отдельные клады вдобавок к пяти кладам мегалоцеросов.

На филогенетическом дереве мегацеринов одна клада синомегацеросов отделилась от общего ствола раньше всех — около 599 тысяч лет назад (722–489 тысяч лет назад при ДИ 95 процентов). Затем выделилась одна клада мегалоцеросов. Время ее отделения, по оценкам ученых, составляет около 349 тысяч лет назад (422–286 тысяч лет назад при ДИ 95 процентов). Две оставшиеся клады синомегацеросов выделились примерно 173 (209–140 тысяч лет назад при ДИ 95 процентов) и 155 тысяч лет назад (188–125 тысяч лет назад при ДИ 95 процентов). Еще три клады мегалоцеросов обособились около 107–97 тысяч лет назад.

Полученные результаты говорят о том, что между двумя родами мегацеринов нельзя провести границу на уровне митохондриальных геномов. Подобные переплетения материнских линий ранее уже встречались и у других млекопитающих. Например, в генофонде пещерных гиен (Crocuta crocuta spelaea / C. spelaea) присутствовали митохондриальные линии, распространенные у африканских пятнистых гиен (C. crocuta), а у прямобивневых слонов (Palaeoloxodon) — распространенные у лесных слонов (Loxodonta cyclotis). Прояснить популяционные взаимоотношения между мегалоцеросами и синомегацеросами должен анализ ядерных геномов.

Ранее на N + 1 рассказывали о том, что пещерные гиены исчезли к северу от Карпат не раньше 34 тысяч лет назад. На это указали останки животных, найденные на юге Польши.