Российские ученые выявили 40 мутаций коронавируса у пациентки с лимфомой

NIH / flickr.com

Российские ученые выявили 40 мутаций у коронавируса, находившегося в организме пациентки с лимфомой на протяжении 318 дней. Из-за опухоли у женщины был ослаблен иммунитет, и нормально функционировали только T-лимфоциты, поэтому 12 из обнаруженных мутаций помогали вирусу обходить именно T-клеточный иммунный ответ. Препринт статьи опубликован на сайте препринтов Research Square.

Коронавирус, который изначально возник в Китае (так называемый уханьский вариант), за время распространения по миру приобрел новые мутации. О том, как он изменился, мы рассказывали в материале «Мы переехали сюда». Коронавирус может мутировать не только в популяции людей, но также и в одном человеке, если инфекция протекает достаточно долго — например, при ослабленном иммунитете. Часть этих мутаций направлена на упрощенное проникновение в клетку, ускользание от антител или снижение распознавания клетками иммунитета, что в дальнейшем может создать проблемы с эффективностью вакцин и усложнить течения ковида.

Российские ученые под руководством Георгия Базыкина (Georgii Bazykin) из Сколковского института науки и технологий и Института проблем передачи информации имени Харкевича описали случай развития множественных мутаций коронавируса у женщины, страдающей неходжкинской B-клеточной лимфомой — злокачественным заболеванием лимфатической системы. Коронавирусную инфекцию у нее диагностировали 17 апреля 2020 года. Позитивные тесты на коронавирус чередовались у нее с негативными на протяжении 318 дней, за это время пневмония развивалась у нее два раза — летом 2020 года и зимой 2021 года. За этот период пациентка прошла несколько курсов химиотерапии. У женщины взяли шесть соскобов из носоглотки (в августе 2020 и в январе 2021) и провели полногеномное секвенирование коронавируса. Секвенирование провели также у человека, от которого пациентка заразилась ковидом.

В общей сложности вирус у пациентки приобрел 40 мутаций, 34 из которых произошли в конце наблюдений. Это соответствует скорости мутаций в 15,3×10-4 на нуклеотид в год, что превышает скорость мутаций в общей популяции. Из 40 мутаций 12 препятствовали распознаванию и нейтрализации коронавируса T клетками.

Для того чтобы оценить иммунный ответ пациентки, у нее взяли анализ крови. В плазме не обнаружили зрелые B лимфоциты, нашли небольшое количество антител IgG, но только в одном из образцов. Вместе с этим ученые наблюдали сильный T-клеточный ответ на коронавирус. Исследователи предполагают, что коронавирус у женщины с лимфомой направленно мутировал, чтобы избежать T-клеточного иммунитета, так как из-за рака лимфатической системы другие виды иммунитета у нее были ослаблены.

Обычно ученые больше внимания уделяют мутациям, которые позволяют коронавирусу избегать антител, но этот клинический случай показывает важность изменений в геноме вируса, которые позволяют ему уходить от T-клеток.

В конце июня в России выявили первый случай заражения мутировавшим индийским штаммом коронавируса — дельта-плюс. Новый вариант отличается от обычного дельта-варианта мутацией S-белка, которая произошла у южноафриканского штамма, считающегося довольно опасным.

Анастасия Кузнецова-Фантони

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl+Enter.