Пересадка кишечного микробиома позволила коалам расширить рацион, сообщается в Animal Microbiome. Животные стали есть листья другого вида эвкалипта, которые они не могли переварить в помощью собственной микрофлоры. Исследователи полагают, что методика может быть полезной для сохранения коал.
Коал (Phascolarctos cinereus) относят к одним из самых специализированных млекопитающих. Они едят только листья эвкалиптов (Eucalyptus) и в зависимости от предпочтений могут кормиться на деревьях от одного до десяти видов. В 2013 году на юго-востоке Австралии коалы в одной из популяций так расплодились, что стали голодать. Они полностью объедали листья любимых ими прутовидных эвкалиптов (Eucalýptus viminális), так что деревья погибали. Это, в свою очередь, привело к смерти 70 процентов местной популяции животных. Но даже голодая, большинство коал не ели листья косых эвкалиптов (E.оbliqua), которые во множестве росли в том же районе — лишь небольшое число местных животных предпочитали есть листья именно E.оbliqua.
Биологи и экологи во главе с Микаэлой Блайтон (Michaela Blyton) из Университета Западного Сиднея предположили, что в описанной ситуации большинству коал не позволил перейти на другой рацион состав кишечного микробиома. Вероятно, в нем не было микроорганизмов, которые помогали бы животным переварить листья косых эвкалиптов. Ученые проанализировали состав кишечной микрофлоры у коал, предпочитавших листья косых и прутовидных эвкалиптов, и обнаружили, что он различается.
В новом исследовании ученые проверили, может ли трансплантация кишечного микробиома помочь коалам сменить диету. Они поймали 12 животных из популяции, которая кормилась листьями прутовидных эвкалиптов, и поместили их в Центре Департамента охраны природы Австралии на мысе Отуэй. Еще до пересадки микробиоты коалам стали предлагать листья E.оbliqua, которые они не ели в дикой природе.
Животных разделили на две группы. В течение девяти дней экспериментальной группе давали кишечную микробиоту животных, предпочитавших листья косых эвкалиптов, а контрольной — микробиоту их собратьев по популяции, которые ели листья прутовидных эвкалиптов. Ученые проверили успешно ли прошла пересадка, проанализировав рибосомную 16S РНК из фекалий животных. Ее последовательность различается у разных бактерий и архей. Затем авторы в течение 18 дней наблюдали за коалами и смотрели, поменяют ли животные рацион.
После того, как у коал из экспериментальной группы изменился состав кишечной микробиоты, они стали есть больше листьев косых эвкалиптов (p = 0.026). Интересно, что животные, которые ели листья обоих видов эвкалиптов и до трансплантации, стали охотнее кормиться листьями косых эвкалиптов. Объяснить это ученые пока не могут.
Полученные ими результаты показывают, что пересадка кишечной микробиоты помогает коалам «переключиться» с одного вида листьев на другой, заключают авторы. Эта методика может пригодиться, чтобы помочь коалам приспособиться к незнакомой пище, так как чересчур размножившихся животных иногда приходится перевозить в другие районы страны.
Ранее исследователи выяснили, как коалы смогли питаться ядовитыми листьями эвкалиптов. У них оказалось больше генов цитохромов Р450. Эти белки окисляют различные вещества, превращая их в растворимые в воде метаболиты, которые быстро выводятся из организма с мочой.
Языковые модели сгенерировали рабочий вирусный геном
Используя геномные языковые модели Evo 1 и Evo 2, американские исследователи под руководством Брайана Хая (Brian L. Hie) из Института Arc сгенерировали полные геномы бактериофагов, похожих на хорошо изученный вирус ΦX174. При этом смесь сгенерированных фагов приспособилась заражать три линии Escherichia coli, устойчивые к ΦX174. Этих результатов уже достаточно для эффектного заголовка о вирусах, созданных искусственным интеллектом. Но за кликбейтом скрывается более интересный вопрос: что именно в этом эксперименте сделала модель — и насколько далеко генерация последовательностей уже продвинулась в сторону проектирования сложных функциональных биологических систем с заданными свойствами?