Ее остатки нашли в испанской пещере Эль-Мирон
Американские и испанские ученые секвенировали древнюю ДНК из остатков семги, обнаруженных в пещере Эль-Мирон — известном палеолитическом памятнике, расположенном на Пиренейском полуострове. Геномное исследование показало, что жившие около 18 тысяч лет назад лососи были ближе к современным популяциям, обитающим в более северных регионах, чем Иберия. Кроме того, митохондриальный анализ указал на то, что эффективный размер популяции самок этого вида в ледниковую эпоху был выше, чем у рыб, которые сегодня обитают в том же регионе. Об этом сообщается в статье, опубликованной в журнале iScience.
Атлантический лосось (Salmo salar), или семга, — один из крупнейших представителей семейства лососевых. В естественной среде он обитает в северной части Атлантического океана, а также впадающих в него реках и некоторых северных озерах. Сегодня семга — важный объект промысла и аквакультуры, поэтому неудивительно, что именно она стала первым генетически модифицированным животным, официально разрешенным к продаже и употреблению в пищу в Канаде и США.
Хотя атлантический лосось все еще распространен в естественной среде, его популяция существенно сократилась за последнее столетие из-за масштабного промысла, а также изменений среды обитания. Более того, на юге Европы субпопуляции семги и вовсе оказались на грани исчезновения или вымерли. При этом данный регион, в частности, Пиренейский полуостров, в свое время даже, по-видимому, выступал одним из рефугиумов (климатических убежищ) для представителей этого вида в ледниковую эпоху. Причем известно, что уже тогда первобытные люди добывали эту рыбу и даже использовали ее образ в искусстве.
Даниэль Гарсия-Соуто (Daniel García-Souto) из Института морских исследований в Виго и его коллеги из Испании и США, включая известного палеогенетика Дэвида Райха (David Reich) из Гарвардского университета, сосредоточили свое внимание на популяционной истории атлантического лосося. Для этого они проанализировали остатки рыб, которые археологи раскопали в пещере Эль-Мирон — важном палеолитическом памятнике, расположенном на севере Испании, где ученые обнаружили останки кроманьонцев ледникового периода, в том числе захоронение так называемой Красной леди из Эль-Мирона.
Для исследования ученые отобрали позвонки древних рыб, которые археологи нашли в культурном слое, сформировавшемся между 18,8 и 16,7 тысячи лет назад — во времена существования мадленской культуры. Генетики секвенировали ДНК из восьми образцов и в семи случаях они успешно реконструировали полные митохондриальные геномы этих особей, хотя и с весьма низкой глубиной покрытия. Кроме того, они получили обрывочные сведения о ядерных геномах исследованных лососей.
Анализ митохондриальных геномов показал, что особи из Эль-Мирона располагаются по материнской линии ближе к лососям, обитающим в реках Великобритании и Франции, чем к рыбам из реки Асон — недалеко от нее находится пещера, где раскопали остатки древних особей. Судя по прочитанным однонуклеотидным полиморфизмам, плейстоценовые лососи с Пиренейского полуострова также генетически ближе к северным популяциям семги, образцы которых происходили с Британских островов и из Норвегии. Кроме того, ученые оценили эффективный размер популяции самок из Эль-Мирона — он составлял приблизительно 1548 особей. Для сравнения: у современных лососей из реки Асон он равняется около 731 единицы, из реки Рында (Мурманская область) и Танаэльв (Норвегия) — примерно по 3000 особей.
С глубокой древности добычей лосося и другой рыбы занимались и доисторические жители Северной Америки. Например, не так давно ученые проанализировали материалы из археологических памятников, расположенных на Аляске, и обнаружили, что обитатели стоянок ловили налимов как минимум 13 тысяч лет назад, а лососей — не позднее 11,8 тысячи лет назад.