Биохимики из Германии выяснили, как в чилибухе Strychnos nux-vomica происходит биосинтез стрихнина и его аналогов. Ученые открыли 9 ферментов, ответственных за реакции биосинтеза, и полностью воспроизвели открытый путь синтеза в табаке Бентхама Nicotiana benthamiana. Исследование опубликовано в журнале Nature.
Стрихнин — токсичный алкалоид, который впервые обнаружили в 1818 году в семенах чилибухи и стали использовать в народной медицине. А когда в 1946 году химики разгадали его структуру, он стал одной из главной целей органиков-синтетиков XX века. В результате попыток его синтеза ученые открыли много новых важных для органической химии превращений.
И хотя химики научились синтезировать стрихнин, как его производят растения, ученым до сих пор неизвестно. На основе экспериментов с изотопными метками удалось установить, что один из исходников для биосинтеза — аминокислота триптофан, а одно из промежуточных соединений на пути синтеза — альдегид Виланда — Гумлиха, напоминающий стрихнин по структуре. Но как именно образуется альдегид, и как он затем превращается в стрихнин, ученые не знали до сих пор.
Химики под руководством Сары О’Коннор (Sarah O'Connor) из Института химической экологии общества Макса Планка взялись за эту проблему и смогли выяснить, как происходит биосинтез стрихнина. Для исследований они взяли образцы чилибухи Strychnos nux-vomica, которая производит стрихнин, стрихноса Strychnos sp., который производит аналоги стрихнина, и катарантус Catharanthus roseus. Далее биохимики анализировали геном трех растений.
Проанализировав сходства генома чилибухи с геномом катарантуса Catharanthus roseus, ученые смогли найти у чилибухи гены, ответственные за синтез ферментов для одного из первых превращений на пути синтеза — реакции триптофана с геранилпирофосфатом.
Биохимики знали, что в катарантусе происходит биосинтез молекул аккуамицина, похожего по структуре на альдегид Виланда — Гумлиха, причем в синтезе участвует фермент оксидаза, нужный для реакции деформилирования. И в процессе поиска схожих ферментов в транскриптоме чилибухи химики обнаружили оксидазу с 46 процентами совпадающих аминокислот. Чтобы подтвердить, что именно с помощью нее происходит синтез аккуамицина, ученые экспрессировали гены, ответственные за синтез оксидазы, в листьях табака Бентхама Nicotiana benthamiana. В масс-спектрах экстрактов из листьев табака химики, как они и ожидали, обнаружили промежуточный продукт биосинтеза стрихнина аккуамицин.
Еще несколько стадий синтеза химики разгадали с помощью перебора разных генов, которые они экспрессировали в листьях табака. В результате им удалось понять, как образуется альдегид Виланда — Гумлиха. А чтобы разгадать последние стадии синтеза, ученые сравнивали геном чилибухи с геномом стрихноса Strychnos sp., который производит не стрихнин, а его аналог диаболин. С помощью анализа генома и последующей экспрессии нужных генов в листьях табака химики смогли выяснить, что стрихнин образуется из альдегида в результате реакций ацилирования и декарбоксилирования, а аналог стрихнина бруцин получается из самого стрихнина в четыре стадии.
В результате химики смогли разгадать синтетический путь биосинтеза стрихнина и его структурных аналогов бруцина и диаболина, а также искусственно воспроизвести этот путь синтеза в табаке. Теперь стало известно, как растения производят очень сложные по структуре алкалоиды.
О том, какие еще яды производит природа, можно прочитать в нашем материале «Парад отравителей».
Михаил Бойм
Небольшой поверхностный заряд мешает им сливаться
Команда американских, китайских и японских физиков предложила механизм, который может объяснить стабильность биомолекулярных нанокапель. Оказалось, что на поверхности самых мелких капель образуется небольшой положительный заряд. Возникает электростатическое отталкивание, которое мешает каплям сливаться. Результаты исследования опубликованы в журнале Physical Review Letters.