«Вектор» назвал случаи обнаружения бразильского гамма-штамма в России единичными

Мутации в спайк-белке гамма-варианта коронавируса

Stanford University

Специалисты из Государственного научного центра «Вектор» рассказали N + 1 о собственных генетических исследованиях распространения штаммов коронавируса на территории России. Согласно их данным, с мая 2021 года в стране было идентифицировано несколько случаев заражения гамма-вариантом (бразильский штамм). Тем не менее основную опасность сейчас представляет дельта-штамм (индийский).

По мере распространения в человеческой популяции вирус SARS-CoV-2, который вызывает ковид, накапливает мутации, которые позволяют ему более эффективно заражать людей или скрываться от иммунного ответа. Варианты вируса, содержащие удачные комбинации мутаций, ВОЗ называет «вызывающими опасения» (variants of concern, VOC). В частности, ученых беспокоят штаммы с мутациями в домене поверхностного S-белка, распознаваемого антителами. Именно S-белок лежит в основе самых эффективных вакцин от ковида.

Среди вызывающих опасения вариантов наиболее значимыми до недавних пор были британский (альфа, B.1.1.7), южноафриканский (бета, B.1.351) и бразильский (гамма, P.1). Все эти варианты, судя по всему, в той или иной степени снижают эффективность вакцин. Подробнее о них можно прочитать в материале «Мы переехали сюда».

Гамма-штамм привлек к себе внимание, когда в конце 2020 года вызвал вспышку в бразильском городе Манаус, где большая часть населения уже переболела ковидом. Исследователи идентифицировали в S-белке гамма-варианта три мутации (K417T, E484K, N501Y), вероятно повышающие сродство к рецептору ACE2, и назвали его примерно в два раза более заразным, чем исходный штамм. Кроме того, авторы статьи в Science, которые провели исследование в Манаусе, предположили, что предшествующий иммунитет к коронавирусу защищает от варианта P.1 только на 54-80 процентов. Кроме того, этот вариант может быть немного смертельнее исходного (в 1.1 — 1.8 раза). Из Бразилии он, вероятно, приехал в январе 2021 года, когда несколько зараженных этим вариантом обнаружили в Токио. Активная фаза распространения его по миру, по-видимому, пришлась на апрель.

Специалисты из Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор», которые активно изучают SARS-CoV-2 с самого начала пандемии, проводят собственные исследования распространения штаммов коронавируса на территории страны. Сегодня они рассказали, что, начиная с мая 2021 гамма-вариант был идентифицирован и в России. Однако, по словам их представителя, это были единичные случаи. Источник отметил, что заболевшие не были привиты. По мнению представителей «Вектора», распространяться этот вариант не будет, так как вытеснится (или уже вытеснен) дельта-штаммом.

Чтобы следить за изменчивостью вируса и распространением разных вариантов по миру, в ряде стран образцы вируса, полученные от больных, секвенируют и выкладывают в общий доступ. Одной из крупнейших баз данных, содержащих актуальную информацию о распространении мутантных штаммов, является GISAID. В России последовательности геномов штаммов туда выкладывает консорциум CORGI, в котором участвуют ученые из нескольких российских институтов. Согласно GISAID, в России гамма-вариант ранее не обнаруживался. По данным отечественных генетиков из консорциума, с конца 2020 года в стране начал активно распространяться альфа-вариант, который в мае стремительно стал вытесняться «дельтой». Об особенностях этого варианта можно почитать в нашем материале «От альфы до дельты».

Дарья Спасская

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl+Enter.