Масштабный метаанализ обнаружил новые генетические факторы риска заболеть ковидом

Географические кластеры взятия образцов у пациентов с разной тяжестью заболевания

COVID-19 Host Genetics Initiative / Nature, 2021

Международный генетический консорциум опубликовал в журнале Nature объединенные данные по 46 исследованиям генетической предрасположенности заболеть ковидом в тяжелой форме. По результатам самого крупного на сегодняшний день метаанализа исследователи выделили 13 генетических локусов, ассоциированных с повышенной вероятностью подхватить инфекцию.

С момента начала циркуляции в человеческой популяции вируса SARS-CoV-2 стало ясно, что некоторые факторы, такие как преклонный возраст или лишний вес, повышают риск развития более тяжелой формы заболевания. Кроме того, риск тяжело заболеть выше у мужчин, чем у женщин. Тем не менее иногда люди легко переносят болезнь даже при наличии факторов риска, а иногда наоборот. Возможная причина этого может заключаться в генетической предрасположенности к развитию осложнений.

С момента начала эпидемии ученые занялись поиском ассоциаций между известными генетическими полиморфизмами и вероятностью заболеть ковидом, переболеть в тяжелой форме или умереть. Данные по отдельным европейским выборкам уже показали, что к тяжелой форме более склонны носители некоторых вариантов, связанных также с группой крови, болезнями легких и воспалением. Тем не менее, для установления более надежных ассоциаций требуются большие массивы данных.

В свежей статье генетики из 19 стран, объединенные проектом COVID-19 HGI (COVID-19 Host Genetics Initiative), обнародовали данные метаанализа 46 отдельных исследований, объединяющих почти 50 тысяч переболевших ковидом (или умерших от него) людей и два миллиона контролей. Такая выборка позволила бы отделить социоэкономические факторы, такие как доступ к медицинской помощи, от истинного вклада генов в вероятность заболеть. Российская популяция тоже попала в эту выборку благодаря нескольким небольшим исследованиям, проведенным в партнерстве с коммерческими фирмами.

Суммарную выборку разделили на три группы: переболевшие ковидом (с подтвержденным диагнозом, или с собственных слов), госпитализированные с ковидом (только с подтвержденным диагнозом) и госпитализированные с критической формой заболевания, которая потребовала искусственной вентиляции легких или закончилась смертью пациента. Из 49562 больных были госпитализированы с умеренной и тяжелой формой 7462 человека и в критическом состоянии 6179 человек. Около 80 процентов больных были европейского происхождения, однако в анализ также вошли люди с африканскими и азиатскими корнями. В качестве контроля были взяты суммарно два миллиона образцов ДНК в пропорциональном этническом соотношении, вне зависимости от того, болели эти люди ковидом, или нет.

Анализ был проведен методом установления полногеномных ассоциаций между отдельными полиморфизмами (вариантами последовательности ДНК) и вероятностью оказаться в одной из трех групп. В итоге исследователи обнаружили 13 генетических локусов, ассоциированных с вероятностью заболеть в той или иной форме, как ранее идентифицированных, так и новых.

Девять из них оказались связаны именно с тяжелой формой болезни. К примеру, один такой локус, — полиморфизм в гене TYK2, — связали с общим снижением функций иммунитета. Два других полиморфизма, положительно ассоциированных с вероятностью очень тяжело заболеть (в генах DPP9 и FOXP4), ранее связывали с повышением риска развития других болезней легких, в том числе аденокарциномы. Две найденных ассоциации оказались связаны только с азиатской популяцией, что лишний раз подчеркнуло необходимость включения в подобные анализы людей разного происхождения.

Кроме того, анализ собранных данных позволил уточнить роль лишнего веса и курения в склонности к заболеванию ковидом. Используя менделевскую рандомизацию, генетики установили причинно-следственную связь между генетической склонностью к повышенному индексу массы тела и вероятностью заболеть. Склонность к курению оказалась связана с повышением вероятности госпитализации.

Генетические исследования в первую очередь могут помочь более точно очертить группы риска, а также пополняют информацию о факторах, влияющих на развитие инфекции. Подробный гид по пандемии ковида по состоянию на весну 2021 года можно прочитать здесь.

Дарья Спасская

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl+Enter.