Ученые впервые доказали in vivo, что выделяющие гамма-аминомасляную кислоту нейроны на ранних стадиях развития являются возбуждающими, а потом становятся тормозными. ГАМК-нейроны гиппокампа трехдневных мышат обладали активирующим эффектом, но к седьмому дню становились тормозными. В зрительной зоне коры мозга такие клетки с рождения оказывали подавляющее действие. Авторы статьи, опубликованной в журнале Science Advances, отмечают, что из-за такой гетерогенности модуляция активности ГАМК-нейронов (например, при лечении эпилепсии) в раннем возрасте может привести к непредсказуемым результатам.
ГАМКергические интернейроны (клетки, которые выделяют в качестве медиатора гамма-аминомасляную кислоту) являются основной тормозной системой мозга млекопитающих и важны для правильной настройки ритмов мозга. Необходимы они и для формирования нейронных сетей в развивающемся мозге, однако их функций и механизм влияния на эмбриональное и постнатальное развитие нервной системы изучены слабо.
Существует гипотеза, согласно которой в молодом мозге ГАМКергические нейроны не подавляют, а, наоборот, возбуждают нервные клетки-мишени и синхронизируют активность нейронов. При созревании сетей коры головного мозга ГАМКергические клетки должны в таком случае перестраивать свою работу и становиться тормозными. До сих пор подтвердить эту гипотезу in vivo не удалось — даже клетки, которые в культуре являются возбуждающими, в мозге живых животных проявляли тормозную активность.
Ясунобу Мурата (Yasunobu Murata) и Мэттью Колоннезе (Matthew Colonnese) из Университета Джорджа Вашингтона изменяли активность ГАМКергических нейронов гиппокампа у новорожденных мышей. Для этого сразу после рождения мышатам делали инъекцию вируса, который доставлял в ГАМКергические клетки гиппокампа рецепторы двух типов: один возбуждал нейроны, если на него попадал клозапин-N-оксид, а другой подавлял их активность при действии сальвинорина B. Затем исследователи вводили мышам одно из этих веществ и наблюдали за активностью гиппокампа с помощью пучка микроэлектродов.
Возбуждение ГАМКергических нейронов клозапин-N-оксидом на третий день от рождения приводило к увеличению активности пирамидных клеток гиппокампа. Сальвинорин B, наоборот, вдвое снижал количество нервных импульсов и амплитуду ритмов в гиппокампе. На седьмой день после рождения зависимость изменилась на противоположную: при активации ГАМКергических нейронов пирамидные клетки гиппокампа затормаживались. В этом возрасте ГАМКергические нейроны не влияли на амплитуду ритмов гиппокампа. Значит, в раннем постнатальном периоде клетки, выделяющие ГАМК, являются возбуждающими и модулируют ритмы гиппокампа, а затем ритмы становятся независимыми, а ГАМК-нейроны — тормозными.
Затем действие ГАМКергических клеток проверили в зрительной коре. В этой зоне как на третий, так и на седьмой день после рождения ГАМК-нейроны обладали тормозной активностью и не влияли на ритмическую активность гиппокампа.
Из-за гетерогенности (в зависимости от возраста и зоны мозга) влияния ГАМК-нейронов в раннем возрасте попытка модулировать их активность на системном уровне (например, при лечении эпилепсии) может привести к непредсказуемым результатам. Чтобы проверить эффект возбуждения или торможения ГАМКергических нейронов в целом в мозге, вирус с рецепторами ввели в энторинальную и соматосенсорную кору (эти области посылают проекции в гиппокамп).
Возбуждение ГАМК-нейронов энторинальной и соматосенсорной коры привело к подавлению активности пирамидных нейронов гиппокампа, а торможение выделяющих ГАМК клеток — к обратному эффекту. Значит, тормозные сигналы нейронов коры «перевешивают» возбуждающую активность интернейронов гиппокампа.
Наконец, ученые проверили достоверность результатов и механизм действия ГАМКергических нейронов другим методом. Для этого воспользовались инструментами оптогенетики: с помощью вируса в нервные клетки доставили активируемые светом белки-каналы для анионов (обычно открытие анионных каналов приводит к торможению клетки). Вирус ввели в в ГАМК-нейроны гиппокампа или в пирамидные клетки той же области и зрительной коры. Во втором случае светочувствительные белки имитировали рецепторы к ГАМК пирамидных нейронов — возможно, именно они обуславливают разное влияние ГАМК-нейронов в разном возрасте.
Оптогенетическое торможение ГАМКергических нейронов гиппокампа приводило к подавлению активности пирамидных клеток в возрасте трех дней, но к активации на седьмой день после рождения. В зрительной коре открытие светочувствительных анионных каналов ослабляло активность пирамидных клеток, но в трехдневном гиппокампе эффект был противоположным — анионная проводимость, хоть и ненадолго, приводила к электрическому возбуждению клеток. К седьмому дню зависимость становилась обратной. Ученые заключили, что гетерогенное влияние ГАМКергических нейронов опосредовано анионными рецепторами к ГАМК.
Недостаток ГАМКергических клеток возникает при некоторых нейродегенеративных заболеваниях, например, при хорее Гентингтона. Чтобы компенсировать погибшие клетки, ученые научились превращать глию в тормозные нейроны — правда, пока только у мышей.
Алиса Бахарева
Проект получил название Unknome
Британские исследователи представили пополняемую и редактируемую пользователями базу данных белков, в которой они ранжируются по степени того, насколько мало о них известно. Проект призван обратить внимание на подобные белки и ускорить процесс их изучения. Публикация об этом появилась в журнале PLoS Biology. Как известно со времени прочтения человеческого генома, в нем закодировано примерно 20 тысяч белков. Применение протеомного и транскриптомного подхода в прошедшие после этого два десятилетия подтвердило, что большинство из них экспрессируются, и позволило выяснить назначение многих из них. Тем не менее, многие белки до сих пор остаются не охарактеризованными несмотря на то, что значительная их часть эволюционно консервативна и может выполнять критически важные функции. Во многом это связано с тем, что исследователи склонны фокусироваться на уже изученных белках, поскольку такие работы дают более предсказуемый результат. Чтобы систематизировать подход к идентификации и характеризации неизвестных белков, сотрудники Лаборатории молекулярной биологии британского Совета по медицинским исследованиям, Кембриджского и Оксфордского университетов под руководством Мэтью Фримена (Matthew Freeman) и Шона Манро (Sean Munro) создали и выложили в открытый доступ базу данных Unknome (буквально «незном», сокращенное от unknown genome — «неизвестный геном»). Она содержит ортологичные по базе PANTHER и собранные в кластеры последовательности белков человека и популярных модельных животных (таких, например, как кишечная палочка, дрозофила и мышь), взятые из базы UniProt. Им присваивается численная оценка «известности» (knownness) на основании аннотаций в проекте Gene Ontology (GO). Пользователи могут присваивать им свою оценку, исходя из имеющейся информации. Авторы работы оценили пригодность Unknome как основания для экспериментальной работы, выбрав с его помощью набор из 260 белков дрозофилы с неизвестными функциями (показатель известности 1,0 и менее), сохранившихся у людей. Нокдаун некоторых из этих генов с помощью РНК-интерференции приводил к утрате жизнеспособности. Функциональный скрининг остальных указал на участие некоторых в фертильности, развитии организма, передвижении, контроле качества синтезированных белков и устойчивости к стрессу. Выборочное выключение генов с использованием CRISPR/Cas9 определило два гена, отвечающих за мужскую фертильность, и компонент сигнального пути Notch, принимающего участив нейрогенезе, онкогенезе и связанного с различными неврологическими заболеваниями и пороками развития. Исследователи заключают, что тщательная оценка недостаточности знаний о функции гена и кодируемого им белка предоставляет ценный ресурс для поиска направлений биологических исследований и, возможно, стратегий их эффективного финансирования. Иногда на точность генетических баз данных могут влиять весьма неожиданные факторы. В материале «Наследили тут» можно почитать о том, как данные в одной из таких баз оказались испорчены неизвестными паразитами.