Американские ученые проверили технологию частичного репрограммирования на клетках человека и мыши. Они выяснили, что 2-4 дня работы факторов репрограммирования сдвигают экспрессию генов так, что клетки от пожилых доноров становятся ближе к клеткам от молодых доноров. При этом их эпигенетический возраст также снижается. Кроме того, с помощью репрограммирования удалось обратить и функциональные дефекты — в клетках человеческого хряща и мышиной мышцы. Исследование опубликовано в журнале Nature Communications.
Технология репрограммирования клеток, то есть возвращения к зародышевому состоянию, известна уже почти 15 лет. Она состоит в том, чтобы тем или иным способом запустить в клетках работу четырех факторов транскрипции (факторов Яманаки), которые выключают гены, связанные со специализацией клетки, и она превращается в эмбриональную стволовую — то есть становится универсальным предшественником для любых клеточных типов.
Cтарение сопровождается истощением запасов стволовых клеток в организме, но и те клетки, что не способны делиться, теряют часть своих функций. Поэтому возникла идея омоложения через репрограммирование. Чтобы не превратить ткани в эмбриональные клетки, ученые пытаются использовать частичное репрограммирование, то есть «включать» работу факторов Яманаки на короткое время. Чтобы достичь этого на мышах, исследователи вывели трансгенных животных, у которых экспрессию факторов Яманаки можно было регулировать, добавляя в корм определенное лекарство. И оказалось, что репрограммирование частично способствует омоложению: ученые работали с ускоренно стареющими мышами и смогли продлить их жизнь.
Но с человеком это провернуть невозможно. Не только потому, что никто не рискнет вывести трансгенных людей, но и потому, что мышиные модели ускоренного старения не вполне повторяют человеческие болезни, а те, в свою очередь, не полностью соответствуют нормальному старению. Поэтому, если мы хотим использовать частичное репрограммирование для продления человеческой жизни, необходимо научиться применять эту технологию на обычных человеческих клетках.
За это взялась группа ученых под руководством Томаса Рэндо (Thomas Rando) из Медицинской школы Стэнфордского университета. В своих предыдущих работах исследователи разработали протокол репрограммирования, который не требует встраивания чужеродных генов в ДНК — они просто регулярно вводят в клетки РНК, кодирующие факторы Яманаки. После двух недель этой процедуры клетки превращаются в зародышевые. При этом, по подсчетам исследователей, примерно на пятый день в клетках появляются признаки стволовых клеток: это время они сочли точкой невозврата.
Чтобы достичь частичного репрограммирования, они вводили РНК факторов Яманаки в течение четырех дней в фибробласты и клетки эндотелия (стенки сосудов) человека. Для этого эксперимента они использовали клетки пожилых (60-90 лет) доноров, а затем сравнивали экспрессию генов в репрограммированных клетках с клетками молодых (25-35 лет) доноров. По профилю экспрессии репрограммированные клетки оказались ближе к молодым, чем к старым донорам. В то же время, в репрограммированных клетках исследователи не обнаружили маркеров стволовых клеток — это значит, что они не потеряли свою специализацию.
Затем ученые проверили, действительно ли репрограммирование связано с омоложением. Для этого они измерили эпигенетический возраст клеток до и после репрограммирования и обнаружили, что фибробласты пожилых доноров стали моложе в среднем на 1,84 года, а клетки эндотелия — на 4,94. Вместе с этим в них появились и другие признаки клеточной молодости: стало больше протеасом и аутофагосом — машин внутриклеточной «уборки» (p < 0,01), а клетки эндотелия стали выделять меньше провоспалительных молекул.
Свою методику исследователи опробовали и на других типах клеток. Например, они выделили клетки хрящевой ткани из суставов пациентов с остеоартритом. После репрограммирования в этих клетках снизилась экспрессия маркеров воспаления и окислительного стресса, они начали чаще делиться и производить больше энергии (p < 0,05). Затем ученые выделили стволовые клетки из мышц пожилых мышей, частично их репрограммировали и трансплантировали в поврежденные мышцы других пожилых мышей. После этого сила сокращения мышц выросла на треть, то есть стволовые клетки стали более активно участвовать в заживлении поврежденных участков.
Тем не менее, до начала экспериментов на людях этой технологии предстоит пройти еще множество проверок. Поскольку даже частичное омоложение клеток чревато приобретением способности к делению, исследователям потребуется неоднократно подтвердить, что в результате их манипуляций клетки не становятся опухолевыми. В этой работе ученые измерили длину теломер репрограммированных клеток и показали, что они не стали длиннее, однако для безопасного применения репрограммирования необходимо будет выяснить, не теряют ли клетки своих основных свойств и не получают ли какие-то новые.
Пока история с омоложением только начинает развиваться, технологию репрограммирования уже успешно используют, например, для лечения глазных болезней. А совсем недавно репрограммированные клетки впервые подсадили в сердце пациента. Кроме того, уже есть идеи того, как репрограммирование может помочь в случае бесплодия и болезни Гентингтона.
Полина Лосева
И отползли от источника звука
Группа исследователей из Китая, США и Южной Кореи выяснила, что нематоды Caenorhabditis Elegans, которые чувствуют звук всем телом, реагируют не на абсолютное звуковое давление, а на его градиент. Из-за этого они способны различать и избегать звуки, которые издают небольшие беспозвоночные хищники, но не реагируют на более громкий шум. Кроме того, такой механизм восприятия градиента звукового давления, по-видимому, общий для многих животных, включая других беспозвоночных и млекопитающих. Работа опубликована в Current Biology. У нематод Caenorhabditis Elegans, как и у многих беспозвоночных, нет органов слуха, но они могут чувствовать звук и уползать от него, то есть проявлять отрицательной фонотаксис. В 2019 году Адам Илифф (Adam Illiff) из Мичиганского университета с коллегами показали, что звуковые вибрации черви ощущают всем телом, а их наружные покровы — кутикула — работают примерно как барабанная перепонка позвоночных. Тогда ученые определили механосенсорные нейроны червей, которые, вероятно, преобразуют звуковые волны в нервный импульс. И выяснили, что воспринимают черви именно колебания воздуха: мутанты, которые не чувствовали вибрацию субстрата, все равно проявляли фонотаксис. Теперь Цань Ван (Can Wang) из Хуачжунского университета науки и технологий (он принимал участие и в прошлом исследовании) и его коллеги из Китая, США и Южной Кореи выяснили, как именно нематоды чувствуют звук. Они размещали рядом с головой нематод динамики разных размеров и включали звуки разной громкости и частоты. Когда ученые помещали маленький динамик диаметром 0,5 миллиметра на расстоянии одного миллиметра от головы нематоды (что примерно равняется длине тела червя), и включали на нем звук частотой 1 килогерц и громкостью 80 децибел, черви разворачивались и ползли в противоположную от звука сторону. Но когда этот динамик заменили на больший, диаметром 3 миллиметра, нематоды не реагировали, хотя звук был таким же. Даже когда громкость увеличивали до 110 децибел или меняли частоту на большую или меньшую, нематоды не меняли траекторию своего движения. Исследователи обнаружили, что кутикула червей вибрирует сильнее всего от звука из маленького динамика. С помощью кальциевой визуализации авторы оценили активность механосенсорных нейронов, которые и реагируют на звуковые колебания. Их активность уменьшалась с увеличением размера динамика, даже если громкость звука была одинаковой. На звук из трехмиллиметрового динамика нейроны червей не реагировали. Также ученые выяснили, что звук из маленького динамика создает наибольший градиент звукового давления в теле нематод — это измерили с помощью миниатюрного микрофона. Давление звука, проходящего через среду, снижается с течением времени, — и в голове червя, которая ближе всего к динамику, оно выше, чем на конце его тела. Если источник звука небольшой, звуковое давление уменьшается быстрее, и таким образом градиент звукового давления по телу червя получается больше. Чтобы изменить звуковой градиент, авторы размещали динамики на разном расстоянии от головы червя — чем ближе был динамик, тем резче градиент. Абсолютное звуковое давление в области головы нематод тем временем не менялось. Черви демонстрировали наиболее устойчивые слуховые реакции только в ответ на резкий градиент. Градиент звукового давления коррелировал и с движением червей, и с вибрацией кутикулы, и с активностью механосенсорных нейронов. Нематоды живут в гниющих листьях на земле, где им могут повстречаться разные беспозвоночные хищники. По всей видимости, именно их звуки — стрекотание, шуршание или шелест крыльев — и могут слышать черви, а вот более громкие звуки от источников большего размера для них не так важны. Градиент звукового давления возникает и в тимпанальных органах кузнечиков, и в заполненной жидкостью улитке млекопитающих. В случае последних этот градиент, по всей видимости, необходим, чтобы активировались механочувствительные волосковые клетки улитки. То есть активация чувствительных к звуку нейронов происходит у разных животных по одному принципу. Ранее ученые обнаружили, что эпигенетическая память позволила нематодам C. elegans избегать патогенных бактерий даже спустя четыре поколения. То есть одни черви встретились с бактерией, выяснили, что она опасна, и стали ее избегать, а их детям и внукам уже не потребовалось проверять бактерий на себе — они избегали их сразу благодаря унаследованным модификациям гистонов.