Команда школьников из Москвы, Казани, Санкт-Петербурга, Барнаула и Ижевска разработала реалистичный (хотя и теоретический) биохимический механизм переключения цвета свечения фотофоров глубоководных рыб. Ключевая идея состоит в использовании сложного комплекса ферментов и транспортных белков, «включающих» и «выключающих» специальный орган-светофильтр, расположенный перед источником свечения рыбы. Предложенный проект помог им победить на Межрегиональном химическом турнире — крупнейшем в России командном соревновании школьников по решению химических задач открытого типа. Заключительный этап турнира прошел с 1 по 7 февраля в УрФУ имени Ельцина, его результаты доступны в официальной группе мероприятия.
Большинство глубоководных рыб используют свечение в коротковолновом диапазоне (зеленый и синий свет) для привлечения потенциальной пищи. Но некоторые из них, в частности представители рода Malacosteus, используют длинноволновый диапазон (красный свет), причем не для охоты, а для того, чтобы лучше видеть пищу. Предложите биохимический процесс, который бы позволил рыбе переключать режим свечения между длинноволновым (когда еды вокруг много) и коротковолновым (когда еду надо привлекать) по ее усмотрению.
Многие виды глубоководных организмов обладают свечением — оно необходимо как для коммуникации между животными, так и для привлечения пищи, отпугивания хищников и других нужд. Часто источником света становятся бактерии, которые обитают в специальном органе, например, иллиции у глубоководных удильщиков. Такие органы называются фотофорами. Кванты света рождаются в реакции окисления люциферина кислородом при участии ферментов – люцифераз. Цвет свечения фотофоров зависит только от того, каким путем происходит окисление люциферина, поэтому изменить его практически невозможно — для другого пути окисления потребуются совершенно другие белки, бактерии или внутриклеточная среда.
Команда-победитель «Бездна межрегионального угнетения» предложила использовать дополнительный «светофильтр», который включается и выключается благодаря сигнальному каскаду в организме рыбы. Светофильтр предложили разместить перед «колбочкой» фотофора, в которой располагаются бактерии. Подобные конструкции встречаются у рыб рода Malocosteus, обладающих сразу двумя различными фотофорами, один из которых светится зеленым, а другой – красным. Клетки светофильтра, согласно решению команды, должны содержать порфирин. Это вещество является структурным фрагментом молекул гемоглобина и хлорофилла. Порфирин способен к люминесценции, то есть к поглощению света одной длины волны (например, синего) и испусканию света другой длины волны (например, красного или желтого). Во включенном состоянии светофильтр превращал бактериальный синий свет в красный.
Для выключения светофильтра школьники предложили целый каскад ферментативных реакций. Дело в том, что то, какую длину волны света поглощает вещество, очень сильно зависит от его структуры. Если удалить из нее даже один атом углерода, характер поглощения и излучения может радикально измениться. Команда предложила ввести в клетку транспортные белки, которые смогут переносить порфирины через каналы в митохондрии. Там порфирины будут быстро окисляться под действием ферментов. В результате на первой стадии один атом углерода порфиринового кольца будет удален, образуется несветящийся коррин. Это выключит светофильтр и свет фотофора снова станет синим. Также команда описала всю цепочку сигнального каскада, который изменяет цвет свечения.
В состав команды «Бездна межрегионального угнетения» входят молодые химики из школ Москвы (СУНЦ МГУ и школа № 218), Санкт-Петербурга (Аничков лицей), Казани (Лицей имени Лобачевского), Ижевска (Лицей №14) и Барнаула (Гимназия №42). Команде удается победить в турнире уже в третий раз подряд.
Химический турнир заключается в решении набора заранее опубликованных задач открытого типа. Каждая из них требует проведения небольшой исследовательской работы, анализа научной литературы, а иногда и проведения экспериментов. Затем команды встречаются очно и защищают свои решения перед другими командами и комиссией жюри. При этом школьники выступают не только в роли докладчиков, но и оппонентов, и рецензентов.
В финал турнира вышло три команды: «Бездна», nishelA_belG (СУНЦ МГУ) и SPDF (школа №77). Команды докладывали свои лучшие решения. Школьники из «Бездны» выбрали для доклада задачу о переключении свечения глубоководных рыб, nishelA предложила собственную гипотезу образования металлопорфиринов в нефти, а SPDF рассказывали о полимере, который может разлагаться в морской воде, но должен быть устойчив в пресной. Все команды-финалисты приглашены к участию на Международный химический турнир (IChTo-2019), который состоится 20-25 августа 2019 года на Химическом факультете МГУ.
Межрегиональный химический турнир проходит уже девять лет, его в этом году его организаторами выступают Химический факультет МГУ и Уральский федеральный университет. Мероприятие проходит при поддержке генеральных партнеров ПАО «Нижнекамскнефтехим», ПАО «Казаньоргсинтез» и Фонда президентских грантов. В 2018-2019 году в региональных и заочном этапе турнира приняло участие свыше 3600 школьников, на заключительный этап приехало более 200 школьников из 27 регионов России.
Ранее мы уже писали о химических турнирах. К примеру, в МХТ-2018 «Бездна» победила научившись рисовать картины, цвета которых можно легко инвертировать химически. В МХТ-2017 победители представили механизм работы молекулярной машины, работающей по принципу молекулярного циферблата. В международных химических турнирах пока побеждают зарубежные команды (Венгрия в 2017 году и Сингапур в 2018 году).
Владимир Королёв
Небольшой поверхностный заряд мешает им сливаться
Команда американских, китайских и японских физиков предложила механизм, который может объяснить стабильность биомолекулярных нанокапель. Оказалось, что на поверхности самых мелких капель образуется небольшой положительный заряд. Возникает электростатическое отталкивание, которое мешает каплям сливаться. Результаты исследования опубликованы в журнале Physical Review Letters.