Ученые выяснили, как растения «чувствуют» запахи и начинают защищаться от вредителей на примере табака и летучих веществ кариофилленов. Как пишут исследователи в Journal of Biological Chemistry, кариофиллены инициируют в растениях выработку белка осмотина, защищающего растения от различных инфекций. Они связываются с аналогом так называемых TOPLESS-белков, которые замедляют синтез РНК в клетках, и, по-видимому, ускоряют выработку осмотина.
В жизни животных запахи играют огромную роль. Летучие органические вещества несут информацию о еде, хищнике или подходящем партнере, находящихся неподалеку. Для растений запахи тоже важны. Известно, что гены растений, кодирующие белки, необходимые для защиты или ответа на стресс, регулируются летучими органическими веществами. Например, растения луновидной фасоли (Phaseolus lunatus), «включали» гены, кодирующие защитные белки, если их листья были заражены вредителями — паутинными клещами. Эти белки привлекают к растению хищных насекомых, которые охотятся на паутинных клещей. Если же лист повреждали искусственно, растения их не вырабатывали. Кроме того, некоторые паразитические растения находят хозяйские организмы «по запаху», по испускаемым теми летучим органическим веществам. Однако как растения улавливают запахи и как летучие вещества запускают синтез нужных белков, было неизвестно.
Японские биологи под руководством Казушиге Тухара (Kazushige Touhara) из Токийского университета выяснили этот вопрос. В качестве модельных они использовали молодые растения и клеточные культуры табака (Nicotiana tabacum). Ранее исследователи выяснили, что растения табака вырабатывают вещества кариофиллены, чтобы защититься от насекомых-вредителей.
Сначала исследователи выяснили, начинается ли экспрессия генов в клеточных культурах табака в ответ на разные летучие вещества. Авторы добавляли к клеткам 11 летучих веществ, которые, предположительно, запускают защитную реакцию у поврежденных растений. В качестве контроля ученые использовали фитогормоны метилжасмотин и салициловую кислоту. Оказалось, что два из них — оксид кариофиллена и α-кариофиллен — инициировали экспрессию белка осмотина. Некоторые растения вырабатывают осмотин для защиты от различных инфекций. Контрольные фитогормоны запускали синтез двух специфичных ферментов, выработку которых они регулируют в растениях. Тестируемые летучие вещества никак не действовали на экспрессию этих генов. То есть летучие вещества очень избирательно регулировали тот или иной ген. Глядя на эти результаты, исследователи предположили, что у летучих веществ есть белки-рецепторы, которые участвуют в регуляции синтеза белков.
Затем японские биологи убедились, что молодые растения табака, также, как и клеточные культуры, синтезируют осмотин. Ученые либо помещали растения в герметичные стеклянные сосуды и добавляли в них α- и β-кариофиллены или оксид кариофиллена, либо они помещали листья табака в растворы этих веществ.
Чтобы определить белок-рецептор, который связывается с кариофилленами и регулирует экспрессию генов, исследователи «связали» кариофиллены с крошечными бусинами. Затем эти бусины подержали в экстракте из листьев табака. В результате ученым удалось «поймать» белок, похожий на встречающиеся в других растениях TOPLESS-белки (белки TPL). В комплексе с другими белками, они замедляют синтез РНК в клетках.
В конце концов исследователи решили выяснить, как действует найденный белок, который они обозначили, как TPL3. Он мог регулировать синтез защитного белка осмотина самостоятельно, или мог связываться с кариофилленами или оксидом кариофиллена. Исследователи создали трансгенные клеточные культуры табака, в которых вырабатывалось очень большое количество белка TPL3. Чтобы отслеживать его синтез, ученые добавили в ДНК-конструкцию зеленый флуоресцентный белок, который светится при облучении синим или фиолетовым светом. Сначала авторы выяснили, что TPL3 скапливается в ядрах клеток. Это говорило о том, что белок задействован в синтезе РНК, который происходит в ядре клетки.
Затем исследователи добавили в трансгенные культуры раствор оксида кариофиллена и проверили, как в клетках синтезируется осмотин. В качестве контроля ученые использовали обычные клеточные культуры табака. Оказалось, что в некоторых трансгенных культурах количество осмотина было ниже, чем в обычных клетках. По предположению авторов, этот результат свидетельствует о том, что белок TPL3 связывался с оксидом кариофиллена и они вместе регулировали синтез осмотина. Возможно, в обычных клетках кариофиллен связывается с белком TPL3 и не позволяет ему замедлять синтез осмотина.
Ранее биологи выяснили, что растения способны оценивать, как растут соседние растения, и в зависимости от этого выбирать собственную стратегию роста, чтобы обогнать конкурентов.
Екатерина Русакова
И еще четырех видов опухолей
Британские и датские иммунологи обнаружили на цитотоксических T-лимфоцитах рецептор, узнающий одновременно три разных опухолевых антигена. Пациент, у которого были обнаружены эти Т-клетки, смог достичь полной ремиссии меланомы четвертой клинической стадии. Такое строение T-клеточных рецепторов не дает клеткам опухоли ускользнуть от противоопухолевого иммунитета. Похожие типы Т-клеточных рецепторов есть и у здоровых людей, но их роль в противоопухолевом иммунитете пока неясна. Исследование опубликовано в виде статьи в журнале Cell. Клеточная терапия онкологических заболеваний направлена на введение в организм Т-лимфоцитов, узнающих фрагменты белков опухоли, выставляемые клетками на поверхности белков главного комплекса гистосовместимости (HLA-антигенов). Она позволяет добиться ремиссии во многих случаях, при которых другие виды лечения неэффективны. Но врачи часто сталкиваются с ускользанием опухолевого клона от такого иммунитета. Иногда достаточно нескольких месяцев, чтобы опухолевые клетки перестали экспрессировать маркер, который должны были узнавать лимфоциты. Хотя большинство Т-лимфоцитов узнают один эпитоп, некоторая часть из многообразия Т-клеточных рецепторов, образующихся в процессе созревания Т-клеток, узнает не один, а сразу несколько антигенов. Такие клетки есть и у здоровых людей, и у пациентов с аутоиммунными болезнями. Рецепторы, нацеливающие иммунную систему сразу на несколько молекул-мишеней, могли бы повысить эффективность клеточной терапии. Ведь даже если с поверхности опухоли исчезнет один антиген, то иммунный ответ против второго сохранится, и лечение останется эффективным. Шаг в сторону использования этого принципа в терапии сделала группа онкологов и иммунологов из Великобритании и Дании под руководством Эндрю К. Сьюэлла (Andrew K.Sewell) из Университета Кардиффа. На протяжении последних 15 лет они занимаются клеточной терапией меланомы. В рамках клинических исследований врачи забирали у пациентов клетки крови, отбирали среди них Т-лимфоциты, тропные к меланоме, и после культивации in vitro вводили клетки обратно пациентам. В одном из исследований, проведенном в 2011-2014 годах, участвовал пациент с четвертой клинической стадией меланомы, у которого клеточная терапия позволила добиться десятилетней ремиссии болезни (обычно же медианная продолжительность жизни с момента постановки диагноза у таких пациентов не превышает года). Ученые решили детально исследовать, с какими особенностями Т-клеточного ответа это было связано. Как выяснили иммунологи, почти вся противоопухолевая активность лимфоцитов пациента была связана одним лимфоцитарным клоном (его обозначили MEL8), который реагировал in vitro не только на меланому, но и на клетки острого миелолейкоза, опухоли молочной, предстательной и поджелудочной железы от других пациентов с таким же типом HLA-антигена (гаплотип HLA A*02:01, наиболее распространенный в мире). Это было неожиданно, ведь рецепторы этих Т-клеток чувствительны к белку мелану A, специфичному для меланоцитов и происходящих от них опухолей (включая меланому). Авторы создали библиотеку из 936 миллиардов декапептидных последовательностей и оценили in silico сродство рецепторов MEL8 к олигопептидам, связанным с HLA A*02:01. Такой скрининг позволил отобрать 500 пептидов, представленных в протеоме человека. Три из них — участки белков мелана А, BST2 и IMP2 — имели сродство к Т-клеточному рецептору MEL8 in vitro и при этом экспрессировались меланомой. У всех трех декапептидных последовательностей нашлась гомология и на уровне аминокислотной последовательности, и на уровне третичной структуры, что было подтверждено рентгеноструктурным анализом. Т-клетки, у которых есть рецепторы, тропные одновременно к мелану А, IMP2 и BST2, были обнаружены у здоровых добровольцев и у одного пациента с хроническим лимфолейкозом, но их количество было невелико. Обнаруженный вид поливалентного рецептора можно использовать и для лечения других пациентов: исследователи секвенировали последовательность Т-клеточного рецептора и трансдуцировали этой последовательностью другие линии лимфоцитов в рамках своих экспериментов. Следовательно, есть предпосылки для создания эффективной клеточной терапии опухолей или противоопухолевой вакцины. Впрочем, пока невозможно говорить, насколько безопасной было бы такое лечение, ведь исследование британских и датских ученых основано лишь на единичных наблюдениях пациентов с опухолями. Кроме того, распознавание эпитопов Т-клеточным рецептором зависит от варианта HLA.антигена, имеющегося у данного конкретного человека, и распространенность полимодальных Т-клеточных рецепторов у носителей разных вариантов HLA может отличаться. Даже сильного иммунного ответа против клеток меланомы может оказаться недостаточно для победы над болезнью — на эффективность лечения могут влиять такие факторы, как уровень тестостерона.