Американские биологи обнаружили, что механизм запрограммированной гибели запускается в клетках в результате волны биохимических реакций, которая распространяется по цитоплазме со скоростью около 30 микрометров в минуту. Сигнал запускается при попадании в цитоплазму цитохрома c, который инициирует цепь циклов с прямой и обратной связью. Такая волна может распространяться по клетке на несколько сотен микрометров, пишут ученые в Science.
Для избавления от поврежденных или инфицированных клеток, а также для регуляции процессов дифференциации и морфогенеза многоклеточные организмы прибегают к механизму программируемой клеточной смерти — апоптозу. Если этот механизм запущен, то клетка начинает распадаться на отдельные тельца, ограниченные клеточной мембраной, которые затем поглощаются соседями с помощью фагоцитоза. Весь этот процесс занимает от одного до трех часов. Однако как именно в клетке происходит запуск апоптоза — как сигнал о необходимости распада распространяется по цитоплазме и с какой скоростью он идет — до сегодняшнего дня оставалось неизвестным.
Чтобы более детально исследовать механизм распространения сигнала о запуске апоптоза, американские биологи из Стэнфордского университета Сяньжуй Чэн (Xianrui Cheng) и Джеймс Феррел мл. (James E. Ferrell Jr.) исследовали этот процесс в цитоплазме из яйцеклетки гладкой шпорцевой лягушки (Xenopus laevis). Эта лягушка обитает в Южной Америке, сама она в длину около 12 сантиметров, но при этом имеет очень большие по размеру яйцеклетки — диаметром около 1,2 миллиметра. Очень часто ооциты и эмбрионы этих лягушек используются в качестве модельных объектов для проведения изучения эмбриогенеза, проведения генетических и биохимических исследований. Судьба этих клеток решается на стадии метафазы второго деления мейоза: либо клетка оплодотворяется и переходит к эмбриогенезу, либо не оплодотворяется и оказывается ненужной, в таком случае запускается механизм ее гибели.
В данном случае ученые использовали ооциты гладкой шпорцевой лягушки в качестве модели для изучения клеток, которые пошли по второму пути и запустили механизм апоптоза. Изначально авторы исследования предполагали два возможных варианта: либо биохимический сигнал о начале процесса разрушения распространяется по цитоплазме в результате случайной диффузии, либо для запуска существует специальная сигнальная цепь из некоторого количества биохимических циклов с прямой и обратной связью, в результате работы которых по цитоплазме проходит «волна включения» апоптоза.
Чтобы определить, какой из этих двух механизмов реализуется на самом деле, из ооцитов в стадии интерфазы ученые выделяли клеточный экстракт — жидкость, которая образуется при разрушении клеток и соответствует составу цитоплазмы. Этот экстракт, который используется для воспроизведения биохимиечских процессов in vitro, помещался в трубку длиной 3–4 миллиметра, после чего в него добавляли цитохром c — гем-содержащий белок, активирующий апоптоз. Используемой длины трубки было достаточно, чтобы с помощью флуоресцентной микроскопии отличить диффузионный механизм от волнового.
Оказалось, что сигнал о запуске механизма гибели распространяется по цитоплазме клетки по волновому механизму. Скорость распространения этой волны составила от 28 до 33 микрометров в минуту (точное значение скорости зависит от изначальной концентрации митохондрий в цитоплазме). При этом ученым удалось обнаружить и те биохимические процессы, которые приводят к движению волны: цитохром приводит к активации нескольких типов каспаз — ферментов, приводящих к расщеплению белков. Так, в образце сравнения (без цитохрома) эти процессы вообще не запускались, и при добавлении в экстракт ингибиторов каспаз волна запуска апоптоза сильно замедлялась.
Тот же механизм ученые обнаружили и в самих ооцитах. Причем измерить скорость распространения волны запуска клеточной гибели ученым удалось для естественного апоптоза, так и для процесса, вызванного искусственно добавлением цитохрома с. В этом случае волна стартовала от вегетативного полюса яйцеклетки и с той же скоростью — около 30 микрометров — в минуту распространялась по клетке. Заметить этот процесс можно было по активации каспаз.
По словам ученых, волны, запускающие в клетках апоптоз, аналогичны кальциевым волнам, которые используются во многих клетках для сигнальных функций: если в случае с кальциевыми волнами источником ионов кальция становится эндо-плазматический ретикулум, то источник волны, запускающей апоптоз, — цитохром, выделяющийся из митохондрий. Биологи утверждают, что полученные ими результаты подтверждают важность волнового механизма в клеточных сигнальных системах, и, вероятно, в будущем удастся найти другие примеры такого способа передачи информации.
Иногда механизм запрограмированной клеточной смерти используется животными для довольно неочевидных целей. Например, недавно группа шведских и французских ученых обнаружила, что регуляция апоптоза используется курами, чтобы придать перьям полосатую окраску.
Александр Дубов
Победители конкурса видео под микроскопом Nikon Small World in Motion 2025
Конкурс микровидео Nikon Small World in Motion отмечает 15-летие. На этот раз жюри выбрало ролики, которые показывают жизнь на клеточном и молекулярном уровне — так, как ее невозможно увидеть невооруженным глазом. Взгляните на пятерку лауреатов этого года.