Урок зельеварения
Зачем лабораториям крысиные хвосты и бледные поганки
Корзина поганок, пучок крысиных хвостов и кровь нерожденных бычков. Кажется, что это рецепт из учебника по зельеварению, — но что-то подобное вы можете встретить и в списке закупок обычной биологической лаборатории. Зачем серьезным людям в белых халатах «волшебные» ингредиенты? Жмите на карточки — расскажем.
В эксперименте 63 из 100 образцов оказались активны против устойчивых патогенов
Австралийские, американские, ирландские, испанские, китайские и немецкие исследователи применили алгоритмы машинного обучения для анализа имеющихся геномных и метагеномных баз данных с целью предсказать и каталогизировать возможные антимикробные пептиды. Это короткие последовательности (10–100 аминокислотных остатков), которые каким-либо образом (чаще всего разрушая микробную стенку) подавляют рост определенных бактерий. Луис Педро Коэльо (Luis Pedro Coelho) из Квинслендского технологического университета с коллегами из пяти стран проанализировал с помощью машинного обучения датасет из 63410 метагеномов и 87920 геномов прокариот (как свободноживущих, так и связанных с многоклеточными организмами-хозяевами). В итоге они составили каталог AMPSphere, в который вошли 863498 неизбыточно повторяющихся потенциальных антимикробных пептидов, и большинства из них в имеющихся базах данных нет. Отчет о работе опубликован в журнале Cell.