Включая высокоонкогенные типы
В ходе однолетнего перекрестного исследования сточных вод в Париже ученые обнаружили 27 генотипов вирусов папилломы человека (ВПЧ). Наиболее часто встречающимися генотипами оказались ВПЧ 6, 53 и 66 типов. Высокоонкогенный тип 16 встречался в 21 проценте образцов, а 18 тип — в пяти. Результаты исследования опубликованы в JAMA Network Open.
На ВПЧ приходится более 30 процентов случаев опухолей, связанных с инфекционными агентами. Хотя большинство ВПЧ-инфекций не сопровождаются симптомами, персистирующая форма может приводить к раку шейки матки или аногенитальной зоны. Клинически ВПЧ делятся на типы с высоким и низким онкогенным риском в зависимости от их связи со злокачественными или доброкачественными поражениями. Например, семнадцать генотипов (включая ВПЧ 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59) связаны с крайне высоким риском развития инвазивного рака шейки матки, а ВПЧ 6, 11, 42 и 43 типов преимущественно участвуют в развитии кондилом.
Хотя почти во всех развитых странах проводится всеобщая вакцинация против онкогенных типов ВПЧ среди девочек-подростков, от 70 до 85 процентов взрослых людей в течение жизни заражаются по меньшей мере одним типом ВПЧ. При этом экологическое распространение и разнообразие циркулирующих типов ВПЧ задокументировано лишь частично.
Исследовательская группа под руководством Винсента Маршала (Vincent Maréchal) из Сорбоннского университета провела перекрестное исследование сточных вод в Париже, чтобы оценить распространенность различных генотипов ВПЧ. Для определения генотипов использовалась полимеразная цепная реакция широкого спектра с использованием маркеров, ассоциированных с человеком. Неочищенные сточные воды собирались дважды в неделю с 24 января 2024 года по 29 января 2025 года на станции очистки, обслуживающей примерно один миллион жителей Парижа.
В общей сложности ученые проанализировали 100 проб сточных вод. Геномы ВПЧ обнаружены во всех образцах (средняя концентрация 7,3 × 103 геномного эквивалента на литр). В течение года выявлен широкий спектр генотипов ВПЧ, всего идентифицировано 27 генотипов ВПЧ. На основании частоты выявления генотипы разделили на три группы. ВПЧ 66, 53 и 6 типов встречались почти в 90 процентов образцов. Во второй группе ВПЧ 39, 73, 42, 56 и 43 типов обнаружены более чем в половине образцов. Примечательно, что среди генотипов, на которые направлены вакцины во Франции, часто выявлялся только ВПЧ 6 типа. Также часто обнаруживались и два канцерогенных типа высокого риска, на которые не распространяются вакцины — ВПЧ 39 и 56 типов. Остальные типы находили менее чем в 30 процентах образцов, включая ВПЧ 59, 45, 35, 33, 58, 31, 51 и 52 типов.
ВПЧ 16 типа нашли в 21 проценте образцов, а ВПЧ 18 типа — в пяти. ВПЧ 42 и 43 типов, которые вызывают кондиломы, присутствовали более чем в 55 процентов, а ВПЧ 11 и 6 типов, ответственные за аногенитальные бородавки, обнаружили в 22 процентах образцов. Ученые также подсчитали, что если бы образцы сточных вод собирались раз в месяц, то не удалось бы выявить до 17 генотипов ВПЧ.
По мнению исследователей, использование мультиплексной полимеразной цепной реакции позволило преодолеть технические ограничения секвенирования, что потенциально позволило расширить стратегии мониторинга. Однако анализ сточных вод для определения экологической распространенности ВПЧ без привязки к сайту выделения вируса (половые органы, мочевыводящие пути или полость рта), а также охвату вакцинацией и сексуальному поведению, не может быть эффективным инструментом эпиднадзора на популяционном уровне.
ВПЧ сожительствует с человеком с давних времен. Например, мы рассказывали, что ВПЧ 16 типа нашли у Усть-Ишимского человека, жившего в Сибири примерно 45 тысяч лет назад и у ледяной мумии Этци.