Польские исследователи провели детальный анализ генома простейшего Monocercomonoides exilis, — единственного на данный момент известного эукариотического организма без митохондрий. Результаты, опубликованные в журнале Molecular Biology and Evolution говорят о том, что в остальном это вполне обыкновенное простейшее, не уступающее по сложности своим ближайшим родственникам.
В 2016 году исследователи из Университета Варшавы сообщили об открытии необычного одноклеточного без митохондрий. Это базовая органелла есть у всех эукариот хотя бы на небольшом участке жизненного цикла, и метамонада Monocercomonoides exilis оказалась единственным исключением из этого правила. По-видимому, эта потеря не сильно ему мешает: организм был выделен из кишечника шиншиллы — бедного кислородом места, в котором для митохондрий «работы» мало. Предварительный анализ генома этого уникального существа показал, что помимо прочего M. exilis потерял гены нескольких других белков, завязанных на работу митохондрии, но сумел компенсировать это, заменив их на аналоги бактериального происхождения.
Утрата столь консервативной органеллы поднимает вопрос о том, почему это произошло и как отразилось на жизни клетки. На примере пластид — почти таких же консервативных органелл растений и водорослей — мы видим, что их утрата часто ассоциирована с паразитическим образом жизни и общей миниатюризацией генома, из которого выкидывается всё лишнее. Первооткрыватели M. exilis, Анна Карнковска (Anna Karnkowska) и ее коллеги продолжили работу над геномом этой метамонады с целью проверить, насколько он сложно устроен и чем он отличается от геномов ближайших родственников с митохондриями.
К удивлению исследователей, структура генома M. exilis оказалась похожа по своей сложности на других эукариот и даже превосходила в этом геномы других метамонад вроде Giardia intestinalis или Trichomonas vaginalis. На это указала доля родственных генов с другими организмами: они в изобилии находились у видов никогда не проходивших через миниатюризацию и сохранивших много древних генов. Дополнительная проверка показала, что отдельные не связанные с митохондриями клеточные механизмы тоже не «урезаны»: исследователям удалось найти большинство обычных белков хроматина, систем синтеза и починки ДНК, а также транскрипции и трансляции. Кроме того, эта метамонада обладает внушительным цитоскелетным аппаратом, включающим в себя «фирменный» для оксимонад аксостиль, четыре жгутика и более-менее стандартный набор белков для их обеспечения. Исследователи проверили и другие клеточные системы, но тоже не обнаружили в них чего-либо сильно выделяющего M. exilis на фоне других эукариот.
Часто уменьшение генома влечет за собой потерю интронов, но и эта черта оказалась выражена у M. exilis крайне слабо: 32000 интронов против меньше чем сотни у других паразитических монад. Интересно, что большое количество интронов увеличивает энергетические затраты клетки на транскрипцию и это должно быть особенно важно при отсутствии митохондрий — главных энергетических станций клетки. Но, исходя из наблюдаемого количества интронов, для M. exilis этот фактор не критичен и он вполне способен обеспечить себя АТФ и без аэробного дыхания.
Таким образом исследователи не обнаружили у этой метамонады никаких уникальных особенностей кроме отсутствия митохондрий. Это необычно, потому что чаще всего потеря одних консервативных функций сопровождается довольно масштабными изменениями других — как в случае паразитического растения Balanofora, утратившего способность к фотосинтезу.
Мухина Вера
Он повышает синтез высокомолекулярной гиалуроновой кислоты
Американские и российские исследователи обнаружили, что трансгенные мыши с повышенной экспрессией гена синтазы гиалуроновой кислоты от голых землекопов меньше подвержены спонтанному и индуцированному раку, дольше живут и дольше сохраняют здоровье. Кроме того, у таких животных значительно снижен уровень воспаления в различных тканях. Отчет о работе опубликован в журнале Nature. Голые землекопы (Heterocephalus glaber) выделяются среди грызунов крайне высокой продолжительностью жизни (в неволе — более 40 лет). Кроме того, у них слабее работают рецепторы внутреннего уха и механизмы торможения в нервной системе, зато замедлено клеточное старение и короче иммунная память (из-за чего у них больше наивных лимфоцитов для реакции на новые инфекции). Одно из главных отличий голых землекопов от других млекопитающих состоит в том, что они практически не болеют раком. Как было показано ранее, это связано с высоким содержанием в их тканях высокомолекулярной гиалуроновой кислоты. Этот гликозаминогликан составляет основу внеклеточного матрикса, участвует в пролиферации и миграции клеток, а также влияет на прогрессирование опухолей, причем его свойства зависят от молекулярной массы — высокомолекулярный обладает защитными свойствами, низкомолекулярный — наоборот. Голые землекопы продуцируют гиалуроновую кислоту с крайне высокой молекулярной массой (более 6,1 мегадальтона), которая оказывает мощную цитопротекцию. Чтобы проверить, производит ли она схожий эффект у других видов животных, сотрудники Университета Рочестера, Гарвардской медицинской школы, Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе и Московского государственного университета под руководством Андрея Селуанова (Andrei Seluanov) и Веры Горбуновой (Vera Gorbunova) создали трансгенных мышей с управляемой повышенной экспрессией гена синтазы 2 гиалуроновой кислоты голого землекопа (nmrHas2). У самок и самцов таких животных наблюдалось повышенное содержание высокомолекулярной гиалуроновой кислоты в мышцах, сердце, почках и тонкой кишке; низкое — в печени и селезенке, утилизирующих ее. Тем не менее оно было ниже, чем у голых землекопов, что, вероятно, связано с более высокой активностью гиалуронидазы у мышей. Наблюдения в когортах из 80–90 животных показало, что экспрессирующие трансген nmrHas2 мыши умирают от спонтанного рака реже, чем обычные (57 против 70 процентов). Эта разница была еще заметнее у пожилых (старше 27 месяцев) животных — 49 против 83 процентов. В эксперименте по химической индукции кожного канцерогенеза нанесением 7,12-диметилбензантраценом (DMBA) и форбол-12-миристат-13-ацетатом (TPA) число папиллом на 21-й неделе от него у трансгенных мышей было почти вдвое меньше, чем у обычных. От пола животных подверженность раку не зависела. Масса тела животных из обеих групп в течение жизни не различалась. При этом экспрессирующие nmrHas2 мыши жили дольше, чем обычные — медианная продолжительность жизни у них была на 4,4 процента, а максимальная — на 12,2 процента больше. У животных женского пола сильнее различалась медианная продолжительность жизни (на девять процентов), а мужского — максимальная (на 16 процентов). Оценка эпигенетического возраста по паттернам метилирования ДНК в печени в возрасте 24 месяцев показала, что у трансгенных мышей он примерно на 0,2 года меньше хронологического. Животные из основной группы жили не только дольше жили, но и дольше оставались здоровыми. У них медленнее, чем в контрольной группе, возрастал интегральный индекс немощности (frailty index), который рассчитывается по 31 физиологическому показателю, и они в пожилом возрасте сохраняли подвижность и координацию движений в тесте на ротароде. Кроме того, у трансгенных самок замедлялось развитие остеопороза. Анализ транскриптомов различных органов и тканей экспрессирующих nmrHas2 пожилых мышей выявил особенности, присущие молодым животным, и пониженный уровень воспаления, связанного с возрастом. Молекулярные исследования показали, что высокомолекулярная гиалуроновая кислота производит противовоспалительные и иммунорегулирующие эффекты, а также предохраняет клетки от окислительного стресса. Кроме того, она стимулирует барьерную функцию кишечного эпителия, сохраняет стволовые клетки кишечника и поддерживает оптимальный состав кишечной микробиоты, что дополнительно способствует снижению возрастного воспаления. Таким образом, высокомолекулярная гиалуроновая кислота, произведенная трансгеном nmrHas2, продлила жизнь мышей и сохранила их здоровье в пожилом возрасте, подавляя возрастные воспалительные реакции. Это значит, что эволюционные адаптации долгоживущих животных, таких как голый землекоп, можно искусственно воспроизвести у других видов — возможно, и у человека — с пользой для их здоровья. Также полученные результаты указывают на потенциал клинического применения высокомолекулярной гиалуроновой кислоты для лечения возрастных воспалительных заболеваний кишечника и других органов, заключают авторы работы. В 2016 году исследователи из Великобритании, Германии и ЮАР выяснили, что низкая болевая чувствительность голых землекопов связана с мутацией гена одного из рецепторов воспринимающих боль нейронов. Годом позже американские, немецкие, британские и южноафриканские ученые показали, что эти животные могут долго обходиться без кислорода — в эксперименте они выжили 18 минут в атмосфере чистого азота, после чего восстановили аэробный метаболизм.