Американские исследователи внесли в ДНК стволовых клеток мутацию, характерную для неандертальского генома, и вырастили из них небольшие органоиды, имитирующие кору головного мозга. Как сообщил руководитель проекта на конференции университета Калифорнии в Сан-Диего, единственная мутация существенно изменила структуру нервных связей и даже форму органоидов. Об эксперименте рассказывается в редакционной заметке Science.
C момента прочтения неандертальского генома исследователи по найденным отличиям в ДНК пытаются понять, как неандертальцы выглядели, мыслили и жили, и насколько сильно отличались от людей современного типа. Особенно ученых интересует функционирование мозга этого вида людей. Современные технологии тканевой инженерии позволяют вырастить в чашке Петри небольшие нейронные агрегаты, имитирующие функцию коры или некоторых других отделов головного мозга. Такие мозговые органоиды, как их называют, можно вырастить из плюрипотентных стволовых клеток. Технологии редактирования генома, в свою очередь, позволяют изменить последовательность отдельных генов и наблюдать, как неандертальские варианты влияют на развитие мозга.
Подобными экспериментами, в частности, планирует заняться группа Сванте Паэбо (Svante Pääbo) — ученого, который опубликовал последовательности неандертальского генома и Денисовского человека, и их коллеги из других институтов. Группа под руководством Элиссона Мюотри (Alysson Muotri) из университета Калифорнии из Сан-Диего впервые сообщила о результате подобного эксперимента на локальной конференции под названием «Воображение и эволюция человека».
Чтобы сделать неандерталец-специфичные органоиды, ученые внесли единственную нуклеотидную замену, соответствующую неандертальскому варианту, в ген NOVA1. Замену внесли при помощи системы CRISPR/Cas9 в ДНК фибробластов, которые затем «обратили» до состояния стволовых клеток и заставили дифференцироваться в нейроны. Ген NOVA1 специфично экспрессируется в нейронах. Белок, кодируемый этим геном, участвует в созревании РНК, а мутации у человека в нем ассоциированы с некоторыми типами рака. Как считают ученые, неандертальский вариант NOVA1 мог привести к образованию сотни измененных белков в неандертальском мозге за счет альтернативного созревания матричной РНК (сплайсинга).
Полученные органоиды, по сравнению с человеческими сферическими агрегатами, оказались странной формы. Нейроны в их составе быстрее мигрировали и образовывали меньше синапсов с формированием непривычных связей между клетками. Мюотри отметил, что сформированные нейронные сети напоминают таковые в мозговых органоидах, выращенных из клеток аутистов. Однако в сочетании с другими специфическими вариантами генов это может дать иную картину строения мозга. Проверить это предстоит в будущих экспериментах.
Подробнее о том, как ученые исследуют мозг и его развитие вне тела человека, можно прочитать в нашем материале «Из головы вон».
Языковые модели сгенерировали рабочий вирусный геном
Используя геномные языковые модели Evo 1 и Evo 2, американские исследователи под руководством Брайана Хая (Brian L. Hie) из Института Arc сгенерировали полные геномы бактериофагов, похожих на хорошо изученный вирус ΦX174. При этом смесь сгенерированных фагов приспособилась заражать три линии Escherichia coli, устойчивые к ΦX174. Этих результатов уже достаточно для эффектного заголовка о вирусах, созданных искусственным интеллектом. Но за кликбейтом скрывается более интересный вопрос: что именно в этом эксперименте сделала модель — и насколько далеко генерация последовательностей уже продвинулась в сторону проектирования сложных функциональных биологических систем с заданными свойствами?