Ученые из Техасского университета развенчали теорию о том, что первым дышащим атмосферным воздухом организмом была многоножка Pneumodesmus newmani. Ранее считалось, что это членистоногое жило 428 миллионов лет назад, но анализ гранул циркона показал, что оно моложе приблизительно на 13 миллионов лет, и никак не могло являться первым дышащим вне воды организмом. Исследование опубликовано в PLOS ONE. Кратко о работе сообщается на Phys.org.
Богатый окаменелостями слой Cowie Harbour Fish Bed в Шотландии, в котором в 2004 году были обнаружены ископаемые останки Pneumodesmus newmani, отнесли к среднему силурийскому периоду (возраст многоножки определили как приблизительно 428 миллионов лет), а саму многоножку посчитали самым древним из известных организмом, способных дышать атмосферным воздухом. Все остальные известные животные того времени дышали кислородом, растворенным в воде. Датировку останков производили на основе исследования найденных в том же слое спор растений, поскольку радиометрический анализ этой почвы был затруднен — там не сумели обнаружить достаточного количества радиоактивных веществ.
Стефани Суарез, старшекурсница, проходившая практику в лаборатории университета, получила от своих руководителей образцы для повторного анализа почвы этих мест и воспользовалась для их очистки, в частности, методом ультразвуковой обработки материала. В результате с помощью лабораторной ультразвуковой установки, перекиси водорода и пластикового контейнера ей удалось успешно выделить около ста гранул циркона из богатой глиной (и поэтому сильно слипающейся) почвы вулканического происхождения. Циркон в данном случае представлял интерес потому, что его гранулы способны удерживать радиоактивные элементы, и ученые рассчитывали с его помощью определить более точный возраст слоя.
После проведения радиометрического анализа выяснилось, что возраст слоя, и, соответственно, найденной в нем многоножки, составляет приблизительно на 13 миллионов меньше ранее описанного. По крайней мере десять гранул оказались «моложе» 428 миллионов лет, что свидетельствует о том, что и сам слой тоже моложе этого возраста (поскольку в нем не могут присутствовать гранулы меньшего возраста, нежели он сам). Возраст образца, взятого немного ниже, чем была найдена многоножка, составил 413.7±4.4 миллионов лет, а на пару десятков метров выше — 414.3±7.1 миллионов.
Новая датировка соответствует девонскому периоду, а не силурийскому, каковой приписывался находке в предыдущих исследованиях. В этот момент на Земле уже не менее десяти миллионов лет обитали дышащие воздухом многоножки и паукообразные. Таким образом, Pneumodesmus newmani, ранее считающаяся самым древним животным, умеющим дышать на поверхности земли, по результатам этого исследования лишилась этого титула.
А о современных многоножках, которые умеют жить как на земле, так и в воде, можно прочитать тут.
Анна Казнадзей
Ученые впервые вызвали партеногенез геномным редактированием
Генетики из американских и британских университетов обнаружили, какие гены отвечают за факультативный партеногенез у дрозофил. Они внесли точечные изменения в мушиные гены, влияющие на текучесть мембран (Desat2), образование центриолей (Polo) и скорость пролиферации (Myc). Мухи-самки из созданной генетической линии успешно вступали в половое размножение, но были при этом способны к партеногенезу как минимум на протяжении двух поколений. Исследование опубликовано в журнале Current Biology. Партеногенез — развитие живых организмов из неоплодотворенной яйцеклетки — широко распространен среди животных. На филогенетическом древе чисто партеногенетические виды нередко соседствуют с практикующими «обычное» половое размножение. Иногда и вовсе удается описать спорадические случаи появления партеногенеза у отдельных представителей непартеногенетических видов. Следовательно, генетическая подоплека партеногенеза может возникать быстро по эволюционным меркам и должна быть в этом случае относительно несложной. Но конкретные молекулярные механизмы партеногенеза часто остаются нерасшифрованными. У мух, неспособных к партеногенезу, яйцо приостанавливается на стадии метафазы I мейоза, а дальнейшее развитие (завершение деления, отделение полярных телец и дальнейшие митотические деления) продолжается лишь после оплодотворения. Но встречаются и факультативно партеногенетические линии, в которых партеногенетические потомки составляют от десятых долей до десяти процентов популяции. Доктор Алексис Сперлинг (Alexis L. Sperling) из Кембриджского Университета с коллегами из американских университетов Мемфиса и Калифорнийского технологического исследовала механизм возникновения факультативного партеногенеза у мух вида Drosophila mercatorum. Генетики отобрали и секвенировали геномы и транскриптомы факультативно и облигатно партеногенетических штаммов D. mercatorum и сопоставили их между собой. При партеногенезе была изменена экспрессия 44 генов, связанных в основном с формированием центриолей и регуляцией клеточного цикла. Несмотря на то, что предки D. mercatorum и более изученной D. melanogaster разошлись более 40 миллионов лет назад, данные сравнительной геномики позволяют воссоздавать на более известном модельном объекте изменения, обнаруженные в геноме менее известного. Ученые воссоздали у D. melanogaster выявленные изменения активности генов, прибегая к CRISPR-редактированию генома, дупликациям генов, введению в геном генов антисмысловых РНК или энхансерных последовательностей. Самый высокий уровень партеногенеза был зарегистрирован в группах трансгенных D. melanogaster, у которых была повышена активность генов Polo (регулятор образования центриолей) или Myc (регулятор клеточного цикла), либо понижена активность генов Slmb (убиквитиновая лигаза, способствующая деградации Myc) и Desat2 (фермент, синтезирующий ненасыщенные жирные кислоты и регулирующий текучесть мембран). У каждого третьего облигатно партеногенетического яйца D. mercatorum полярные тельца или женские пронуклеусы вступали в митотические деления, давая начало эмбрионам (такая же картина наблюдалась в каждом восьмом случае факультативно партеногенетических линий). Количество полярных телец, способных спонтанно вступать в митоз (и тем самым формировать эмбрион) повышалось при повышении активности генов Myc и Polo. При этом многие мухи из партеногенетических линий после целлюляризации становятся недиплоидными (чаще всего, триплоидными) из-за нарушения образования веретена деления. Ученые получили 21 тысячу мух-самок D. melanogaster, гомозиготных по мутантным аллелям генов Polo, Myc и Desat2, и содержали их в отсутствии самцов. В общей сложности самки дали 143 взрослых потомка (в среднем 0,7 потомка на 100 мух), а у тех, в свою очередь, появилось два партеногенетических взрослых потомка второго поколения (1,4 процента от численности предыдущего поколения). Таким образом, линия животных, способных к партеногенезу на протяжении нескольких поколений, была впервые получена при помощи геномного редактирования. На основании полученных данных авторы предполагают следующий механизм факультативного партеногенеза. Повышение текучести мембран (цитоплазматической и мембраны эндоплазматического ретикулума) влияет на формирование центра организации микротрубочек и, следовательно, веретена деления. Его образование упрощает вступление в митоз. Такие изменения могли стать эволюционно выгодным приобретением при расселении мух в более холодные регионы (повышение текучести мембран, связанное со снижением активности десатураз, улучшает выживаемость мух при низких температурах). Впрочем, детали возникновения партеногенетических линий мух пока не до конца изучены — судя по диспропорции между небольшими изменениями в геноме и выраженным транскриптомным изменениями, часть изменений у партеногенетических D. mercatorum может носить эпигенетический характер (важность эпигенома для партеногенеза ранее была показана в эксперименте на мышах). О медийной шумихе вокруг возможности партеногенеза у человека и о генетических предпосылках к нему читайте в нашем материале «Половинка себя».