Американские ученые показали, что некоторые популяции рыбы фундулюс, живущие вдоль восточного побережья США, всего за 60 лет приспособилась к загрязнению, уровень которого в норме в тысячи раз превышает смертельный для этого вида. Статья опубликована в журнале Science.
Обыкновенный фундулюс (Fundulus heteroclitus) — небольшая тропическая рыба из отряда карпозубообразных, которая живет в морской воде, устьях рек и соленых болотах вдоль восточного побережья США. Некоторые участки побережья сильно загрязнены индустриальными отходами. Многие из этих отходов токсичны, а содержание их в воде часто достигает летального уровня. Несмотря на все возрастающее количество отходов, множество популяций фундулюса продолжают жить даже в сильно загрязненных водоемах и явно адаптировались к загрязнению. При этом уровень токсичности во многих таких водоемах в тысячи раз превышает уровень, который могут пережить рыбы того вида, живущие в чистых водоемах.
Чтобы выяснить, какие генетические изменения произошли при адаптации фундулюса к загрязнению, авторы отсеквенировали полные геномы 384 рыб из четырех сильно загрязненных и четырех незагрязненных водоемов. Также исследователи секвенировали транскриптомы (совокупность всех РНК), чтобы проанализировать экспрессию генов.
В геномах рыб, живущих в загрязненных водоемах, обнаружились сотни изменений, ассоциированных с толерантностью к загрязнению. Некоторые из этих адаптаций были уникальны для каждой популяции. Но многие изменения совпадали у рыб из разных популяций, хотя образовались, судя по всему, независимо. Это позволяет предполагать конвергентную эволюцию устойчивости к загрязнениям.
Многие из обнаруженных генетических изменений были сосредоточены в генах сигнального пути арил-гидрокарбонового (AHR) рецептора. У «обычных» рыб, живущих в чистых водоемах, этот сигнальный путь выполняет множество функций, одна из которых — защита от токсинов, в том числе ароматических соединений. Чтобы проверить, как функционирует этот сигнальный путь у обычных рыб и рыб, адаптировавшихся к загрязнению, авторы выращивали и тех, и других в чистой воде и затем добавляли туда токсичные вещества. Оказалось, что у обычных рыб в ответ на это активировалось множество генов AHR-пути, что вполне естественно: рыбы пытались справиться с токсинами. У рыб же, устойчивых к загрязнению, AHR-путь никак не реагировал в ответ на токсины — то есть был к ним нечувствителен.
Такая адаптация объясняется тем, что вызванная токсинами активация AHR-пути на ранних этапах развития рыб вызывает у них сильные нарушения развития, приводящие к смерти эмбрионов и мальков. У рыб, толерантных к загрязнению, «отключилась» чувствительность этого сигнального пути, и токсины больше не вызывают у них нарушений развития. Кроме того, поскольку защита от токсинов — далеко не единственная функция AHR-пути, у устойчивых к загрязнению рыб произошло также множество генетических изменений в других сигнальных путях, компенсирующих выключение этого пути. В частности, защиту от токсинов, за которую у обычную рыб отвечает AHR-путь, тоже взяли на себя другие молекулярные каскады.
Интересно, что у рыб из разных популяций выключение AHR-пути произошло за счет разных мутаций. Иными словами, у эволюции устойчивости к загрязнению был единый результат, но разные пути его достижения. Однако самое удивительное заключается в том, насколько быстро произошли эти изменения. Загрязнение водоемов, в которых сейчас живет фундулюс, началось только в 1950-х годах, так что все эти адаптации возникли всего за несколько десятков поколений. Произошло это благодаря двум факторам. Во-первых, у фундулюса исходно был очень высокий уровень генетического разнообразия, так что у эволюции был большой выбор вариантов. Во-вторых, фундулюсы — территориальные рыбы и не склонны к миграциям, благодаря чему их гены, адаптировавшиеся к загрязнению, не смешиваются с генами обычных рыб.
Недавно ученые показали, что загрязнение окружающей среды уже достигло даже дна Марианской впадины: в организмах ракообразных, живущих на глубине около 10 тысяч метров, нашли следы органических загрязнителей, синтезированных людьми.
Софья Долотовская
Автор публикации про редактирование генома белком NgAgo под давлением научного сообщества отозвал статью из журнала Nature Biotechnology, где она была опубликована в мае 2016 года. Об этом сообщают Nature и сайт Retraction Watch.