В открытом доступе появился интерактивный 3D-атлас эмбрионального развития
Нидерландские ученые создали и выложили в открытый доступ 3D-атлас первых двух месяцев эмбрионального развития человека. Об этом авторы сообщают на страницах журнала Science.
Иллюстрации в современных учебниках по эмбриологии содержат множество неточностей. По понятным причинам получение образцов человеческих эмбрионов ограничено, поэтому многие данные основаны на зарисовках 50—100-летней давности или экстраполированы с наблюдений у животных. Из-за этого на многих иллюстрациях некоторые развивающиеся органы расположены не на своем месте или появляются не в свое время.
Чтобы снабдить студентов, врачей и ученых современными данными, сотрудники Академического медицинского центра в Амстердаме вручную проанализировали и оцифровали около 15 тысяч гистологических препаратов из коллекции Института Карнеги. Они идентифицировали и снабдили цифровыми метками 150 органов и структур. Полученную информацию использовали для 3D-реконструкции и моделирования эмбрионов с 15–17 до 56–60 дня развития.
Все модели, классифицированные по стадиям развития, были преобразованы в интерактивный формат 3D-PDF и выложены на сайте, откуда их можно скачать для изучения. Модели позволяют рассмотреть как эмбрион в целом, так и отдельные структуры, органы и системы. Размеры эмбрионов даны в миллиметрах и в сравнении с ладонью взрослого человека.
Кроме того, атлас содержит гистологические срезы с описаниями в форматах Amira и 3D-tiff.
Работа над созданием атласа велась с 2009 года и потребовала больше 45 тысяч человеко-часов. Ее выполняла группа эмбриологов при помощи 75 студентов.
Недавно в сети появились атлас анатомии и гистологии мозга с микронным разрешением, а также карта «семантического словаря» мозговой коры. Также ученые собрали глобальную базу данных мест, языков, культур и окружающей среды.
Олег Лищук
Для его создания использовали три метода визуализации
Аллан Джонсон (Allan Johnson) из Дьюкского университета с коллегами представил трехмерный стереотаксический атлас мозга мыши, охватывающий анатомические структуры и клетки. Для его создания мозг и череп пяти мышей визуализировали тремя способами. Сначала мозг в черепной коробке трехмерно визуализировали диффузно-тензорной томографией с разрешением 15 микрометров (в 2,4 миллиона раз выше, чем у клинических томографов), которое позволяет рассмотреть цитоархитектуру мозговых структур. Затем с помощью микрокомпьютерной томографии отметили опорные точки черепа. После этого мозг извлекли и сделали снимки его срезов микроскопией плоскостного освещения, чтобы получить карты клеток. Результаты работы опубликованы в журнале Science Advances.