Анализ ДНК из более чем двух тысяч образцов современных и древних домашних свиней и кабанов помог исследователям разобраться, как домашние свиньи попали в Европу. Их домашние предки жили на Ближнем Востоке, а при колонизации Европы гибридизовались с местным диким подвидом, так что признаков, по которым можно было бы определить изначальное родство, практически не осталось. Результаты работы опубликованы в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
До последнего времени вопрос происхождения европейских домашних свиней оставался открытым. Дело в том, что ранее ученые наткнулись на несовпадение результатов исследований, сделанных разными методами. Археологические находки говорят о том, что впервые свиньи были одомашнены на Ближнем Востоке, а в Европе появились восемь тысяч лет назад. Генетический анализ древних образцов подтверждает, что примерно семь тысяч лет назад домашние свиньи действительно имели ближневосточное происхождение, но затем их генетические подписи заменяются на близкие к коренным европейским диким свиньям. Это могло, впрочем, произойти из-за активного скрещивания домашних свиней с дикими. Недавний анализ однонуклеотидных полиморфизмов у современных свиней говорит в пользу этой идеи, но до сих пор исследователям не хватало доказательств для однозначного подтверждения гипотезы.
Чтобы повысить точность своего исследования Лорен Франц (Laurent A. F. Frantz) из Оксфордского университета и его коллеги взяли не только генетические данные современных домашних свиней, но и добавили туда археологические образцы, соответствующие домашним и диким европейским и ближневосточным свиньям. Всего набралось 2099 образцов митохондриальной ДНК домашних и 67 ядерных геномов диких свиней. Идея проверки заключалась в следующем: если бы одомашнивание в Европе происходило независимо, то в современной ДНК свиней не было бы совсем никакого ближневосточного следа, а если верна гипотеза о скрещивании, то некоторые генетические подписи будут все-таки ближневосточными. Более того, не исключено, что эти подписи будут располагаться в генах, так или иначе связанных с одомашниванием.
Ниже приведено распределение генетических меток в свиньях разных периодов — от неолитических до современных. Видно, что количество ближневосточных меток постепенно сокращается и на смену им приходят европейские, а в последние 180 лет свиней начинают скрещивать с их китайскими сородичами. Это подтвердило и дополнительное исследование однонуклеотидных полиморфизмов, по которым свиньи отличались между собой.
Несмотря на то, что свидетельств ближневосточного происхождения в геномах свиней практически не осталось, авторы попробовали найти хотя бы несколько уцелевших следов. Они рассмотрели отдельно ген MC1R, который может накапливать функциональные мутации — например, потеря камуфлирующей окраски, характерная для одомашненных животных. Исследование показало, что одна из таких мутаций, отвечающая за черный или черно-белый окрас шкуры домашних свиней, отсутствует у их диких сородичей, но уже есть в геномах древних домашних свиней с ближневосточным происхождением. Таким образом эта мутация стала связующим звеном между древними и современными домашними свиньями и косвенно подтвердила их родство.
Недавно ДНК из древних геномов помогла исследователям разобраться в происхождении Юстиниановой чумы. Оказалось, что все эпидемии были вызваны близкородственными штаммами, так что, по-видимому, у чумной палочки были естественные резервуары, в которых она сохранялась между эпидемиями.
Вера Мухина